RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 ITGB3P05106 788 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 EPHB1P54762 984 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 PPP3CAQ08209 521 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 DUSP8Q13202 625 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 BDH2Q9BUT1 245 aa5.88□□□□□ -1.47
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PTPRK-215ENST00000498284 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
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PTPRK-215ENST00000498284 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRK-215ENST00000498284 MST1LQ2TV78 715 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM240Q5SV17 173 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRK-215ENST00000498284 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
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PTPRK-215ENST00000498284 IP6K2Q9UHH9 426 aa5.86□□□□□ -1.47
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PTPRK-215ENST00000498284 ABLIM3O94929 683 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP5.85□□□□□ -1.47
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PTPRK-215ENST00000498284 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 ARL8AQ96BM9 186 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 BCO1Q9HAY6 547 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 INTUQ9ULD6 942 aa5.85□□□□□ -1.47
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PTPRK-215ENST00000498284 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 PATE3B3GLJ2 98 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 CRHR1P34998 444 aa5.84□□□□□ -1.47
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PTPRK-215ENST00000498284 MIER2Q8N344 545 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRK-215ENST00000498284 DNERQ8NFT8 737 aa5.84□□□□□ -1.47
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PTPRK-215ENST00000498284 K7ESM1 405 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 ADCY6O43306 1168 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF623O75123 536 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 ENDOD1O94919 500 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 IL33O95760 270 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 SYN1P17600 705 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 GZMKP49863 264 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 PER3P56645 1201 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 FOXL1Q12952 345 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-215ENST00000498284 ICAM4Q14773 271 aa5.83□□□□□ -1.48
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