RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495354.1

ARF4-208, Transcript of ADP ribosylation factor 4, human

TSL 3

Gene ARF4, Length 495 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARF4-208	ENST00000495354	INPPL1	O15357	1258 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	LILRB3	O75022	631 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	DDHD2	O94830	711 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	POMC	P01189	267 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	OR1G1	P47890	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	NPEPPS	P55786	919 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	FERMT3	Q86UX7	667 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	TMEM143	Q96AN5	459 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	KCNK12	Q9HB15	430 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	IPP	Q9Y573	584 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	CLUH	O75153	1309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	STK36	Q9NRP7	1315 aa		13.56	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	C2CD2L	O14523	706 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	DSG1	Q02413	1049 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	POU5F1B	Q06416	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	NPY5R	Q15761	445 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	XKR9	Q5GH70	373 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	SIX5	Q8N196	739 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	WASF1	Q92558	559 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	WNT16	Q9UBV4	365 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		13.55	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	TRIO	O75962	3097 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	TEX28	O15482	410 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	B4GALT3	O60512	393 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	DGAT1	O75907	488 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	MLH1	P40692	756 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	PTEN	P60484	403 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	DSC1	Q08554	894 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	STK3	Q13188	491 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	UBXN11	Q5T124	520 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	CSRNP2	Q9H175	543 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	PIDD1	Q9HB75	910 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	MARCH5	Q9NX47	278 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	ARL5C	A6NH57	179 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	STK25	O00506	426 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	TSPAN1	O60635	241 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	SRF	P11831	508 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	SCNN1G	P51170	649 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	GRIK3	Q13003	919 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	ANGPT1	Q15389	498 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	GAD1	Q99259	594 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	ARID2	Q68CP9	1835 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ARF4-208	ENST00000495354	LYPLA2	O95372	231 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARF4-208	ENST00000495354	PAPLN	O95428	1278 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARF4-208	ENST00000495354	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARF4-208	ENST00000495354	POTED	Q86YR6	584 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARF4-208	ENST00000495354	HAS1	Q92839	578 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARF4-208	ENST00000495354	DYDC2	Q96IM9	177 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARF4-208	ENST00000495354	AIFM3	Q96NN9	605 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARF4-208	ENST00000495354	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARF4-208	ENST00000495354	ANKEF1	Q9NU02	776 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ARF4-208	ENST00000495354	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ARF4-208	ENST00000495354	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.52	□□□□□ -0.25
ARF4-208	ENST00000495354	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ARF4-208	ENST00000495354	NPR3	P17342	541 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ARF4-208	ENST00000495354	KRT2	P35908	639 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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