RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490435.5

ITGA4-211, Transcript of integrin subunit alpha 4, humanhuman

TSL 5

Gene ITGA4, Length 720 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4-211ENST00000490435 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.31□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.31□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.31□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 NELL1Q92832 810 aa6.31□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 OXSMQ9NWU1 459 aa6.31□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 DKK2Q9UBU2 259 aa6.31□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 E9PSI1 815 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 LEFTY2O00292 366 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 JMJD7P0C870 316 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 TYRP1P17643 537 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 CD40P25942 277 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 SEC24CP53992 1094 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 GUCY1B3Q02153 619 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 CFAP100Q494V2 611 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 PRR16Q569H4 304 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 XYLT1Q86Y38 959 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 LILRB2Q8N423 598 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 ZMAT4Q9H898 229 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 SPON1Q9HCB6 807 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.3□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.29□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 HLA-DOAP06340 250 aa6.29□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 KRTAP10-11P60412 298 aa6.29□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 BLOC1S1P78537 153 aa6.29□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 NHLH2Q02577 135 aa6.29□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.29□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 FERMT2Q96AC1 680 aa6.29□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 RSAD1Q9HA92 442 aa6.29□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 PIPSLA2A3N6 862 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 NRP2O60462 931 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 CXCR5P32302 372 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 LRRC32Q14392 662 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 DDB1Q16531 1140 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 LMBR1LQ6UX01 489 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 GLCCI1Q86VQ1 547 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 PASD1Q8IV76 773 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 IFT57Q9NWB7 429 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 USP18Q9UMW8 372 aa6.28□□□□□ -1.4
ITGA4-211ENST00000490435 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 SPATA31D3P0C874 917 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 MGAT1P26572 445 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 GPR15P49685 360 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 NRG3P56975 720 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 FOXI1Q12951 378 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 OR10H5Q8NGA6 315 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 GAB3Q8WWW8 586 aa6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 APBA1Q02410 837 aa6.26□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 SYT12Q8IV01 421 aa6.26□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 EFHBQ8N7U6 833 aa6.26□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 SIMC1Q8NDZ2 872 aa6.26□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 A0A1W2PR48 441 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 UNC119BA6NIH7 251 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 B5MCH6 92 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 GAS7O60861 476 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 PFKMP08237 780 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 RBP3P10745 1247 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 SDSP20132 328 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 MGAT5Q09328 741 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 EFCAB12Q6NXP0 572 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 SLC9A6Q92581 669 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 C8orf37Q96NL8 207 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 ORAI3Q9BRQ5 295 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 TEX101Q9BY14 249 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 POGKQ9P215 609 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 MSRAQ9UJ68 235 aa6.25□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 ZNF185O15231 689 aa6.24□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 ESRRBO95718 433 aa6.24□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 CLEC2LP0C7M8 214 aa6.24□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 MXRA7P84157 204 aa6.24□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 UBE3CQ15386 1083 aa6.24□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa6.24□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
ITGA4-211ENST00000490435 KIF18BQ86Y91 864 aa6.24□□□□□ -1.41
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