RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 ING3Q9NXR8 418 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 SERPINB13Q9UIV8 391 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 DNM3Q9UQ16 869 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 DIP2BQ9P265 1576 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 E2F8A0AVK6 867 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 MATN2O00339 956 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 PARNO95453 639 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 IL33O95760 270 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 SCGB1D2O95969 90 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 PF4V1P10720 104 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 CTSSP25774 331 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 MCAMP43121 646 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 KIR2DL3P43628 341 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ADCY7P51828 1080 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP2CBP62714 309 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP2CAP67775 309 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAM8P78325 824 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 PPP3CAQ08209 521 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 MUM1L1Q5H9M0 696 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 KRT40Q6A162 431 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 LILRA6Q6PI73 481 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 TAS1R1Q7RTX1 841 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 PLEKHH3Q7Z736 793 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP4.31□□□□□ -1.723e-6■■□□□ 14.2
RABGGTB-211ENST00000489450 SNX33Q8WV41 574 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 NRG4Q8WWG1 115 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 LPPQ93052 612 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 LRRC37BQ96QE4 947 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ADI1Q9BV57 179 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC6A15Q9H2J7 730 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 TLR9Q9NR96 1032 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 GIT1Q9Y2X7 761 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ADAMTS12P58397 1594 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 SYNJ2O15056 1496 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 AKR1B10O60218 316 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 VSIG10L2P0DP72 767 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ADKP55263 362 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 RAC3P60763 192 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 NOMO1Q15155 1222 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 UAP1L1Q3KQV9 507 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR156Q8NFN8 814 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2I1PQ8NGU4 316 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 DPF2Q92785 391 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 COA7Q96BR5 231 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 GPHA2Q96T91 129 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 MEGF9Q9H1U4 602 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 PARD6AQ9NPB6 346 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 JADE2Q9NQC1 790 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 NCDNQ9UBB6 729 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 SOGA1O94964 1423 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ADCY10Q96PN6 1610 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 NCANO14594 1321 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 RPTORQ8N122 1335 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 TSPOAP1O95153 1857 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 MTSS1O43312 755 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 LAMTOR5O43504 91 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 TSPAN6O43657 245 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC16A1P53985 500 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 EPHB4P54760 987 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 RIN1Q13671 783 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 SEPT2Q15019 361 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 C3orf36Q3SXR2 165 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 FMNL3Q8IVF7 1028 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 TPH2Q8IWU9 490 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 CHPFQ8IZ52 775 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 MIER2Q8N344 545 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 RABGGTAQ92696 567 aa4.29□□□□□ -1.72
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RABGGTB-211ENST00000489450 LMF1Q96S06 567 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 CSRNP2Q9H175 543 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 INTUQ9ULD6 942 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 OAZ3Q9UMX2 235 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 NUP160Q12769 1436 aa4.29□□□□□ -1.72
RABGGTB-211ENST00000489450 HECW2Q9P2P5 1572 aa4.28□□□□□ -1.72
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