RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 NCAPH2Q6IBW4 605 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 RASSF8Q8NHQ8 419 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 NUP133Q8WUM0 1156 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TMEM174Q8WUU8 243 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 CCDC114Q96M63 670 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 MYBL1P10243 752 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 LSP1P33241 339 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 KRT2P35908 639 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SLMAPQ14BN4 828 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 RETREG2Q8NC44 543 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TBC1D22BQ9NU19 505 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SQORQ9Y6N5 450 aa8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 GH1P01241 217 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 CPT1AP50416 773 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 NAPAP54920 295 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 MGAT3Q09327 533 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 XRCC4Q13426 336 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TTLL4Q14679 1199 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 PTPAQ15257 358 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TTMPQ5BVD1 217 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 DPP9Q86TI2 863 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 NOSTRINQ8IVI9 506 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 ALG1Q9BT22 464 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 POLR3EQ9NVU0 708 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 STK24Q9Y6E0 443 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PPC1 479 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 YEATS4O95619 227 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 ZNF18P17022 549 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 FECHP22830 423 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TUBP50607 506 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 USH1GQ495M9 461 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SMUG1Q53HV7 270 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 FAM126BQ8IXS8 530 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 CRIPAKQ8N1N5 446 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 NACA2Q9H009 215 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 BRCA2P51587 3418 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 WNT7AO00755 349 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 CYP2B6P20813 491 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TNFAIP2Q03169 654 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 PTGISQ16647 500 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 ALS2CLQ60I27 953 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 NLRX1Q86UT6 975 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 OXER1Q8TDS5 423 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 NSMCE1Q8WV22 266 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 AIFM3Q96NN9 605 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SPAG5Q96R06 1193 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 CORO1BQ9BR76 489 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TMEM260Q9NX78 707 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 VPS54Q9P1Q0 977 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 ASB3Q9Y575 518 aa8.32□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SCN5AQ14524 2016 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 A0A1W2PQY0 241 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 MYADML2A6NDP7 307 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 MSH4O15457 936 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 FAM107AO95990 144 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 CMA1P23946 247 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 TRPC1P48995 793 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 NR1I3Q14994 352 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 CCDC121Q6ZUS5 278 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 SLC15A3Q8IY34 581 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 CPXCR1Q8N123 301 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 ARRDC4Q8NCT1 418 aa8.31□□□□□ -1.08
USP4-211ENST00000485450 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.31□□□□□ -1.08
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