RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	SCFD2	Q8WU76	684 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	BICD1	Q96G01	975 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	VTA1	Q9NP79	307 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	SNX12	Q9UMY4	172 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	BRCA2	P51587	3418 aa		10.45	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CCDC151	A5D8V7	595 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF233	A6NK53	670 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	GPR25	O00155	361 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	EXTL3	O43909	919 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	GGPS1	O95749	300 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ACTN1	P12814	892 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ARL2	P36404	184 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	AP3M2	P53677	418 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	SP2	Q02086	613 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	PTK2	Q05397	1052 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	KIF22	Q14807	665 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CLUL1	Q15846	466 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CBWD6	Q4V339	395 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TEX35	Q5T0J7	233 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	IER5	Q5VY09	327 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ZPBP2	Q6X784	338 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	KSR1	Q8IVT5	923 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	NAGPA	Q9UK23	515 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	NENF	Q9UMX5	172 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MYH10	P35580	1976 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CEP290	O15078	2479 aa		10.44	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	COL1A2	P08123	1366 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	NCAN	O14594	1321 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101		A0A087X0T9	212 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101		A0A0U1RQJ8	604 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TMEM150B	A6NC51	233 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	RCCD1	A6NED2	376 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	EVI5	O60447	810 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	FAM228B	P0C875	321 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TRIM49	P0CI25	452 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TRIM49C	P0CI26	452 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	GPC3	P51654	580 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MFAP3	P55082	362 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CLDN10	P78369	228 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	SP4	Q02446	784 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CYP24A1	Q07973	514 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TFDP1	Q14186	410 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	PSMD6	Q15008	389 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	H2AFV	Q71UI9	128 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	CAGE1	Q8TC20	777 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ATP8B4	Q8TF62	1192 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		10.43	□□□□□ -0.74
UFD1-208	ENST00000484101	BSND	Q8WZ55	320 aa		10.43	□□□□□ -0.74

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