RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 K7ERI5 159 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 OFD1O75665 1012 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 EDN1P05305 212 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 PLS3P13797 630 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 ATL3Q6DD88 541 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 ZNF558Q96NG5 402 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D13Q9NVG8 400 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 HES2Q9Y543 173 aa22.92■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 TRIP11Q15643 1979 aa22.91■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.91■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 CSPG5O95196 566 aa22.91■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.91■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.91■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.91■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 APOL6Q9BWW8 343 aa22.91■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 CFAP45Q9UL16 551 aa22.91■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 CITO14578 2027 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 A0A0C4DFX4 3053 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 SLC16A4O15374 487 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 FGF18O76093 207 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 BRD1O95696 1058 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 DDIT3P35638 169 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 PPM1AP35813 382 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 PBX3P40426 434 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 SMTNP53814 917 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 SPIRE2Q8WWL2 714 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 TMEM134Q9H6X4 195 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 USP20Q9Y2K6 914 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 BRWD1Q9NSI6 2320 aa22.9■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 CUTAO60888 179 aa22.89■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 MLH1P40692 756 aa22.89■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 STAT6P42226 847 aa22.89■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.89■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 SPPL3Q8TCT6 385 aa22.89■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 POF1BQ8WVV4 589 aa22.89■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.89■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 THEGQ9P2T0 379 aa22.89■■□□□ 1.26
NELFE-208ENST00000481121 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 FAM13AO94988 1023 aa22.88■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 UBE3AQ05086 875 aa22.88■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 GBP3Q9H0R5 595 aa22.88■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 RNF39Q9H2S5 420 aa22.88■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.88■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.88■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 POMCP01189 267 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 DNAJB1P25685 340 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 BCAR1P56945 870 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 STRN3Q13033 797 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 GIT2Q14161 759 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 TAS1R3Q7RTX0 852 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 PARVGQ9HBI0 331 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 CARNS1A5YM72 827 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 ARL5CA6NH57 179 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 H0YCG3 227 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 AKAP5P24588 427 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 ME1P48163 572 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 CAMK1Q14012 370 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 PDILTQ8N807 584 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 ZFP42Q96MM3 310 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 GAD1Q99259 594 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 SPG21Q9NZD8 308 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 PARP2Q9UGN5 583 aa22.87■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 A0A087X0B3 334 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 INPPL1O15357 1258 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 ZNF131P52739 623 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-208ENST00000481121 NCKAP1LP55160 1127 aa22.86■■□□□ 1.25
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