RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 EPHA7Q15375 998 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 POTEHQ6S545 545 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 C4orf19Q8IY42 314 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 RNF149Q8NC42 400 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 RPS6KC1Q96S38 1066 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 PAAF1Q9BRP4 392 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 LXNQ9BS40 222 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 TMEM175Q9BSA9 504 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 GPR62Q9BZJ7 368 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 SFXN1Q9H9B4 322 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 RXFP1Q9HBX9 757 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 MAN1C1Q9NR34 630 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 CHST7Q9NS84 486 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 DUSP12Q9UNI6 340 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 USP20Q9Y2K6 914 aa12.13□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 ARL5CA6NH57 179 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 LARGE1O95461 756 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 ALDH2P05091 517 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 EDN1P05305 212 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 AOC1P19801 751 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 GLRA2P23416 452 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 KLRC2P26717 231 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 YWHABP31946 246 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 MLH1P40692 756 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 DNM2P50570 870 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 RAB27AP51159 221 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 CLCN5P51795 746 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 CDC42EP1Q00587 391 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 CYP4A11Q02928 519 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 MBTD1Q05BQ5 628 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 CAPSQ13938 189 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 PPP4R3AQ6IN85 833 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 LILRA6Q6PI73 481 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 KRT25Q7Z3Z0 450 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 FLCNQ8NFG4 579 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 FAN1Q9Y2M0 1017 aa12.12□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 NEFLP07196 543 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 SKIP12755 728 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 RPL17P18621 184 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 AKAP5P24588 427 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 PSMA5P28066 241 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 ARL2P36404 184 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 NUBP1P53384 320 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 AK2P54819 239 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 DSG1Q02413 1049 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 ST3GAL1Q11201 340 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 TDGQ13569 410 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 GIT2Q14161 759 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 XKR9Q5GH70 373 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 CCDC149Q6ZUS6 474 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 NEK8Q86SG6 692 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 PLCD3Q8N3E9 789 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 PGBD4Q96DM1 585 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 FAM20AQ96MK3 541 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 HSD17B14Q9BPX1 270 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 C22orf23Q9BZE7 217 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 TM6SF1Q9BZW5 370 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 KLK14Q9P0G3 267 aa12.11□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 DMXL1Q9Y485 3027 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 ADAM12O43184 909 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 PFKFB2O60825 505 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 CFHP08603 1231 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 ITGA4P13612 1032 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 RFC5P40937 340 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 OR1G1P47890 313 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 NCAPH2Q6IBW4 605 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 GALNT17Q6IS24 598 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 PPFIBP1Q86W92 1011 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 PALB2Q86YC2 1186 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 CCDC105Q8IYK2 499 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 TRIM22Q8IYM9 498 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 SIX5Q8N196 739 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 URGCPQ8TCY9 931 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 APOL6Q9BWW8 343 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 TMEM60Q9H2L4 133 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 GPRC5CQ9NQ84 441 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 PDRG1Q9NUG6 133 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 NCOR2Q9Y618 2525 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 CEP250Q9BV73 2442 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa12.1□□□□□ -0.47
NISCH-206ENST00000474188 ARID2Q68CP9 1835 aa12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms