RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 EIF6P56537 245 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
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SHQ1-204ENST00000468347 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
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SHQ1-204ENST00000468347 NEU1Q99519 415 aa2.35□□□□□ -2.03
SHQ1-204ENST00000468347 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP2.35□□□□□ -2.03
SHQ1-204ENST00000468347 KCTD5Q9NXV2 234 aa2.35□□□□□ -2.03
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SHQ1-204ENST00000468347 DNAI1Q9UI46 699 aa2.35□□□□□ -2.03
SHQ1-204ENST00000468347 DMTF1Q9Y222 760 aa2.35□□□□□ -2.03
SHQ1-204ENST00000468347 NOX1Q9Y5S8 564 aa2.35□□□□□ -2.03
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