RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467683.5

UBE2Q1-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 370 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-202ENST00000467683 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 FBXL16Q8N461 479 aa12.89□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 TBCKQ8TEA7 893 aa12.89□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 TCP11Q8WWU5 503 aa12.89□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 RSAD2Q8WXG1 361 aa12.89□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 PHKBQ93100 1093 aa12.89□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 CCDC51Q96ER9 411 aa12.89□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 SHDQ96IW2 340 aa12.89□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 MYADMQ96S97 322 aa12.89□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 PIDD1Q9HB75 910 aa12.89□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 MARCH5Q9NX47 278 aa12.89□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 TMEM150BA6NC51 233 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 ASAP2O43150 1006 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 EDIL3O43854 480 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 ERLIN2O94905 339 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 EFEMP2O95967 443 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 POMCP01189 267 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 SP9P0CG40 484 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 LAMP2P13473 410 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 ITGA4P13612 1032 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 AXLP30530 894 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 OR1G1P47890 313 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 QARSP47897 775 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 NLRP5P59047 1200 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 DSC1Q08554 894 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 NTRK3Q16288 839 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 COLGALT2Q8IYK4 626 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 TRIM22Q8IYM9 498 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 KIAA2013Q8IYS2 634 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 HACE1Q8IYU2 909 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 ETNPPLQ8TBG4 499 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 GPR152Q8TDT2 470 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 BRF1Q92994 677 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 MBOAT7Q96N66 472 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 SH2D3AQ9BRG2 576 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 SLC26A6Q9BXS9 759 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 VPS54Q9P1Q0 977 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 FNIP2Q9P278 1114 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 PCDHA4Q9UN74 947 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 R4GN57 208 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa12.88□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 ANHXE9PGG2 379 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 RFPL2O75678 378 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 P4HBP07237 508 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 SDHBP21912 280 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 HTR4Q13639 388 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZNF528Q3MIS6 628 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 SPECC1Q5M775 1068 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 UBXN11Q5T124 520 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 GALNT17Q6IS24 598 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 GJA10Q969M2 543 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 CEP170P1Q96L14 293 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 COLEC11Q9BWP8 271 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 PRKD2Q9BZL6 878 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 NT5C3AQ9H0P0 336 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 CHST7Q9NS84 486 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 DLL3Q9NYJ7 618 aa12.87□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 ARL5CA6NH57 179 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 SPTLC1O15269 473 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 KINO60870 393 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 TDP2O95551 362 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 DCNP07585 359 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 MAGEA9P43362 315 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 STARD6P59095 220 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 PPP2R5CQ13362 524 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP41Q3LFD5 358 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 PLA2G4FQ68DD2 849 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 NOTUMQ6P988 496 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 OTUD6AQ7L8S5 288 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 DAGLBQ8NCG7 672 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 PJA1Q8NG27 643 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 FAM20AQ96MK3 541 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 AGXT2Q9BYV1 514 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 MINDY3Q9H8M7 445 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 IPPQ9Y573 584 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 F5P12259 2224 aa12.86□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 TGM5O43548 720 aa12.85□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 MLH1P40692 756 aa12.85□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 NPEPPSP55786 919 aa12.85□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 EMC2Q15006 297 aa12.85□□□□□ -0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 FUT10Q6P4F1 479 aa12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms