RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467594.1

NISCH-205, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 1,014 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-205ENST00000467594 KRT79Q5XKE5 535 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 SLC27A1Q6PCB7 646 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 DTHD1Q6ZMT9 781 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 ZNF280BQ86YH2 543 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 TMEM87AQ8NBN3 555 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 VN1R2Q8NFZ6 395 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 SNX29Q8TEQ0 813 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 CASP10Q92851 521 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 DNAJB4Q9UDY4 337 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 KIAA1024Q9UPX6 916 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 SMC3Q9UQE7 1217 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 FAN1Q9Y2M0 1017 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 GIT1Q9Y2X7 761 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 IRAK3Q9Y616 596 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 DDHD2O94830 711 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 POMCP01189 267 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 CTSAP10619 480 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 MAPK6Q16659 721 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 DEPTORQ8TB45 409 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 KIFAP3Q92845 792 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 IFT74Q96LB3 600 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 ZBP1Q9H171 429 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 BHMT2Q9H2M3 363 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 FZD8Q9H461 694 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 DNM3Q9UQ16 869 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-205ENST00000467594 ARL5CA6NH57 179 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 B4GALT5O43286 388 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 NR1I2O75469 434 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 CA8P35219 290 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 ECM1Q16610 540 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 TMEM31Q5JXX7 168 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 ANKRD54Q6NXT1 300 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 KCTD17Q8N5Z5 321 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 GAD1Q99259 594 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 HES2Q9Y543 173 aa17.08■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 MUC3AQ02505 3323 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 NRP1O14786 923 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 N4BP3O15049 544 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 GPR37L1O60883 481 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 NPTXRO95502 500 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 COL9A1P20849 921 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 MLH1P40692 756 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 EFNA5P52803 228 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 RBM10P98175 930 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 TPRNQ4KMQ1 711 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 LLGL2Q6P1M3 1020 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 COLGALT2Q8IYK4 626 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 BSNDQ8WZ55 320 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 SUSD6Q92537 303 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 APOL6Q9BWW8 343 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 RNF39Q9H2S5 420 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 NCOR1O75376 2440 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 ACKR2O00590 384 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 DCXO43602 365 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 B4GALT3O60512 393 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 DSC1Q08554 894 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 IL17AQ16552 155 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 TMEM132AQ24JP5 1023 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 PPFIBP1Q86W92 1011 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 ADPGKQ9BRR6 497 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 S1PR5Q9H228 398 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa17.06■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 LOC730098B7Z3J9 87 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 PRKCBP05771 671 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 OR1G1P47890 313 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 SCNN1GP51170 649 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 ITIH3Q06033 890 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 CES5AQ6NT32 575 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 SYCE2Q6PIF2 218 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 ZFP42Q96MM3 310 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 LRFN3Q9BTN0 628 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 COLEC11Q9BWP8 271 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 CCDC113Q9H0I3 377 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 DZANK1Q9NVP4 752 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 PARP2Q9UGN5 583 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-205ENST00000467594 PP2D1A8MPX8 630 aa17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms