RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 TMEM206Q9H813 350 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 COL1A2P08123 1366 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 GAS2O43903 313 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 IQCF3P0C7M6 154 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 ALCAMQ13740 583 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 PPP2R5AQ15172 486 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 EXOC8Q8IYI6 725 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 C7orf31Q8N865 590 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 RDH13Q8NBN7 331 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 GOLGA1Q92805 767 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 UNC93B1Q9H1C4 597 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 UBE4BO95155 1302 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 K7ERI5 159 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 N4BP3O15049 544 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 CETN3O15182 167 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 FOXR2Q6PJQ5 311 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 DESI2Q9BSY9 194 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 FHOD1Q9Y613 1164 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 GRIN2DO15399 1336 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 A0A087WZ62 844 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 RRN3P2A6NIE6 340 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 PES1O00541 588 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 GYPCP04921 128 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 CASP14P31944 242 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 SLC17A8Q8NDX2 589 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 KATNAL1Q9BW62 490 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 CDHR5Q9HBB8 845 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 DMAC2Q9NW81 257 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 GINS2Q9Y248 185 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 TERF2Q15554 542 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 KIZQ2M2Z5 673 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 MIIPQ5JXC2 388 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 CEP112Q8N8E3 955 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 BICD1Q96G01 975 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 CEP63Q96MT8 703 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 GOLGA8IPA6NC78 632 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 GOLGA8JA6NMD2 632 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 CYP2C9P11712 490 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 TMOD1P28289 359 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 MTF1Q14872 753 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC40Q4G0X9 1142 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC155Q8N6L0 562 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 DNAJB3Q8WWF6 145 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC113Q9H0I3 377 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 B4GALT5O43286 388 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 ZEB2O60315 1214 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 MSCO60682 206 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 KPNA6O60684 536 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 STRN3Q13033 797 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 RNF180Q86T96 592 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 SAAL1Q96ER3 474 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 ABHD10Q9NUJ1 306 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.27■□□□□ 0.84
CAPN3-209ENST00000466222 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 HOXC8P31273 242 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 PTENP60484 403 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 FAM114A1Q8IWE2 563 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 NLRP7Q8WX94 980 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 WDR81Q562E7 1941 aa20.26■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 A0A1W2PQC6 194 aa20.25■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
CAPN3-209ENST00000466222 EXOC3O60645 756 aa20.25■□□□□ 0.83
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