RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 SOD2P04179 222 aa25.22■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 ITGA4P13612 1032 aa25.22■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 PTENP60484 403 aa25.22■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 CYP4A11Q02928 519 aa25.22■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 CCDC149Q6ZUS6 474 aa25.22■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 COLGALT2Q8IYK4 626 aa25.22■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.22■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 IPPQ9Y573 584 aa25.22■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 FAM205CA6NFA0 338 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 ARL5CA6NH57 179 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 PROB1E7EW31 1015 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 C2CD2LO14523 706 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 TSPAN1O60635 241 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 PFKFB2O60825 505 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 ERLIN2O94905 339 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 SLITRK3O94933 977 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 CTDNEP1O95476 244 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 EFEMP2O95967 443 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 TPH2Q8IWU9 490 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 SLFN12Q8IYM2 578 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 RPS6KC1Q96S38 1066 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 GAD1Q99259 594 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 MTRQ99707 1265 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 HES2Q9Y543 173 aa25.21■■□□□ 1.63
USP4-208ENST00000464168 AXLP30530 894 aa25.2■■□□□ 1.62
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USP4-208ENST00000464168 AK2P54819 239 aa25.2■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 DSC1Q08554 894 aa25.2■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 CPB2Q96IY4 423 aa25.2■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa25.2■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 MFSD1Q9H3U5 465 aa25.2■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 MIOSQ9NXC5 875 aa25.2■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 TEX28O15482 410 aa25.19■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
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USP4-208ENST00000464168 OR1G1P47890 313 aa25.19■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 TDGQ13569 410 aa25.19■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 KIAA0319Q5VV43 1072 aa25.19■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 NOTUMQ6P988 496 aa25.19■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 CCDC51Q96ER9 411 aa25.19■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 HSD17B14Q9BPX1 270 aa25.19■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 CSRNP2Q9H175 543 aa25.19■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 KCNK12Q9HB15 430 aa25.19■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 MAN1C1Q9NR34 630 aa25.19■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa25.19■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 DENND4AQ7Z401 1863 aa25.18■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 F8W810 466 aa25.18■■□□□ 1.62
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USP4-208ENST00000464168 NR5A1Q13285 461 aa25.18■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 AMHR2Q16671 573 aa25.18■■□□□ 1.62
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USP4-208ENST00000464168 TNFRSF25Q93038 417 aa25.18■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 ZFP42Q96MM3 310 aa25.18■■□□□ 1.62
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USP4-208ENST00000464168 RXFP1Q9HBX9 757 aa25.18■■□□□ 1.62
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USP4-208ENST00000464168 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa25.17■■□□□ 1.62
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USP4-208ENST00000464168 LYPLA2O95372 231 aa25.17■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 ADH1AP07327 375 aa25.17■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 SCNN1GP51170 649 aa25.17■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 MBTD1Q05BQ5 628 aa25.17■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa25.16■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 FDPSP14324 419 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 NPR3P17342 541 aa25.16■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 ARL2P36404 184 aa25.16■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 GLUD2P49448 558 aa25.16■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 CAPSQ13938 189 aa25.16■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 TFDP1Q14186 410 aa25.16■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 FLCNQ8NFG4 579 aa25.16■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa25.16■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.16■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.16■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 DUSP12Q9UNI6 340 aa25.16■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 GIT1Q9Y2X7 761 aa25.16■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 PLXNA3P51805 1871 aa25.15■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 GLUD1P00367 558 aa25.15■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 KRT2P35908 639 aa25.15■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 NBL1P41271 181 aa25.15■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 DSG1Q02413 1049 aa25.15■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 ASCL5Q7RTU5 278 aa25.15■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 GSTCDQ8NEC7 633 aa25.15■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 WASF1Q92558 559 aa25.15■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 APOL6Q9BWW8 343 aa25.15■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
USP4-208ENST00000464168 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
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