RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457718.5

TNS3-208, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TNS3, Length 3,836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-208ENST00000457718 EEPD1Q7L9B9 569 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 ACTRT1Q8TDG2 376 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 TMEM117Q9H0C3 514 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 GANQ9H2C0 597 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 TMEM206Q9H813 350 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 VCPKMTQ9H867 229 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 C5P01031 1676 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 CCT8L1PA6NM43 557 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 CALRP27797 417 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 SHMT1P34896 483 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 SKOR1P84550 965 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 PPP2R5DQ14738 602 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 SCYL2Q6P3W7 929 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 ZBTB33Q86T24 672 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 PALB2Q86YC2 1186 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 ANKMY2Q8IV38 441 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 DEPTORQ8TB45 409 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 RSAD2Q8WXG1 361 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 RUBCNQ92622 972 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 PWWP2AQ96N64 755 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 PPP1R16BQ96T49 567 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 ZWILCHQ9H900 591 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 PHF2O75151 1096 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 MYBL1P10243 752 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 SCP2P22307 547 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 GBP1P32455 592 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 SOX10P56693 466 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 BASP1P80723 227 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 ITIH3Q06033 890 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 CLUL1Q15846 466 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 ARSHQ5FYA8 562 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 GRK7Q8WTQ7 553 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 RILPQ96NA2 401 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 HSPBP1Q9NZL4 362 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 TRPC6Q9Y210 931 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 GJA3Q9Y6H8 435 aa11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 FAM187AA6NFU0 413 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 PIAS1O75925 651 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 BAG2O95816 211 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 PLS3P13797 630 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 ELF1P32519 619 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 SLC47A2Q86VL8 602 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 CBWD2Q8IUF1 395 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 TTC16Q8NEE8 873 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 SH3GL2Q99962 352 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 HSPA6P17066 643 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 DLG4P78352 724 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 MTMR1Q13613 665 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 EPHA7Q15375 998 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 CASC4Q6P4E1 433 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 ANKRD35Q8N283 1001 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 CALN1Q9BXU9 219 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 CCDC160A6NGH7 325 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 UBOX5O94941 541 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 RPL21P46778 160 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 SLC12A3P55017 1021 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 DNAJC3Q13217 504 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 AGBL2Q5U5Z8 902 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 IZUMO3Q5VZ72 239 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 YIPF3Q9GZM5 350 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 CARD9Q9H257 536 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 NOD2Q9HC29 1040 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 ERVK-5Q9HDB9 667 aa11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TNS3-208ENST00000457718 GRIN2DO15399 1336 aa11.65□□□□□ -0.55
TNS3-208ENST00000457718 PYGMP11217 842 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS3-208ENST00000457718 ACOT2P49753 483 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS3-208ENST00000457718 RASA3Q14644 834 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS3-208ENST00000457718 SEZ6Q53EL9 994 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS3-208ENST00000457718 C6orf163Q5TEZ5 329 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS3-208ENST00000457718 PRUNE1Q86TP1 453 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS3-208ENST00000457718 LDHDQ86WU2 507 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS3-208ENST00000457718 AGBL1Q96MI9 1066 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS3-208ENST00000457718 IWS1Q96ST2 819 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS3-208ENST00000457718 GINM1Q9NU53 330 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS3-208ENST00000457718 F5H423 210 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
TNS3-208ENST00000457718 C21orf2O43822 256 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS3-208ENST00000457718 ECE2O60344 883 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS3-208ENST00000457718 APBA3O96018 575 aa11.64□□□□□ -0.55
TNS3-208ENST00000457718 ITGA8P53708 1063 aa11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms