RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453707.6

CITED1-209, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene CITED1, Length 998 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-209ENST00000453707 TSPAN1O60635 241 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 JAK2O60674 1132 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 USO1O60763 962 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 MCM7P33993 719 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 MTMR3Q13615 1198 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 PTPN14Q15678 1187 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 UBXN11Q5T124 520 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 KIAA1841Q6NSI8 718 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 PLCD3Q8N3E9 789 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 TNFRSF25Q93038 417 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 GAD1Q99259 594 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.68□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 A0A087WWV3 80 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 LRRIQ4A6NIV6 560 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 LYPLA2O95372 231 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 MLH1P40692 756 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 RARRES1P49788 294 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 MRE11P49959 708 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 PTPN5P54829 565 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 GUCY1B3Q02153 619 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 POU5F1BQ06416 359 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 CAPSQ13938 189 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 KANK3Q6NY19 840 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 UBALD2Q8IYN6 164 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 ERMNQ8TAM6 284 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 KLHL5Q96PQ7 755 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 COLEC11Q9BWP8 271 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 PARP2Q9UGN5 583 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 DPP7Q9UHL4 492 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 SORCS3Q9UPU3 1222 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 HES2Q9Y543 173 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 C5orf42Q9H799 3197 aa14.67□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 WDR81Q562E7 1941 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 ARL5CA6NH57 179 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 POTEMA6NI47 508 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 NPTXRO95502 500 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 SOD2P04179 222 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 ADH1AP07327 375 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 CNPP09543 421 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 ARL2P36404 184 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 SCNN1GP51170 649 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 C8orf76Q96K31 380 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 RNF39Q9H2S5 420 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 LIMD1Q9UGP4 676 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 GIT1Q9Y2X7 761 aa14.66□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 B4GALT3O60512 393 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 LIG1P18858 919 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 GLRA2P23416 452 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 GLUD2P49448 558 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 CLCN4P51793 760 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 MBTD1Q05BQ5 628 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 IER5LQ5T953 404 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 SLC27A1Q6PCB7 646 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 OTOP3Q7RTS5 596 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 FAM184AQ8NB25 1140 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 MCPH1Q8NEM0 835 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 MTMR9Q96QG7 549 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 NACC1Q96RE7 527 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.65□□□□□ -0.06
CITED1-209ENST00000453707 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 ASGR2P07307 311 aa14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 AKAP5P24588 427 aa14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 AVPR2P30518 371 aa14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 ZNF174Q15697 407 aa14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 GPR149Q86SP6 731 aa14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 PRSS33Q8NF86 280 aa14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 ASIC4Q96FT7 647 aa14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 ZFP42Q96MM3 310 aa14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 VN1R3Q9BXE9 311 aa14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 NFKBIZQ9BYH8 718 aa14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 BACH2Q9BYV9 841 aa14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 TMEM60Q9H2L4 133 aa14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CITED1-209ENST00000453707 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.9 ms