RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	BIRC3	Q13489	604 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	EPN3	Q9H201	632 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	WDR64	B1ANS9	1081 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	PPFIA2	O75334	1257 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	KCNA3	P22001	575 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ADSS	P30520	456 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SFN	P31947	248 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	NIM1K	Q8IY84	436 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SHC3	Q92529	594 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	HVCN1	Q96D96	273 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ERP44	Q9BS26	406 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	STK32B	Q9NY57	414 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		18.26	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	NDUFAB1	O14561	156 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	KRT76	Q01546	638 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CXCL9	Q07325	125 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	RASA3	Q14644	834 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	PTGIS	Q16647	500 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	AGBL2	Q5U5Z8	902 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	KRT35	Q92764	455 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SEMA4D	Q92854	862 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	TEPSIN	Q96N21	525 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	PXMP2	Q9NR77	195 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	TBX20	Q9UMR3	447 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	GOLGA8J	A6NMD2	632 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	HSPA6	P17066	643 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	COPB2	P35606	906 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	PEX5	P50542	639 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	DGKZ	Q13574	1117 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	XKR9	Q5GH70	373 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	MORC4	Q8TE76	937 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ARID2	Q68CP9	1835 aa		18.25	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	USP8	P40818	1118 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	MFAP3	P55082	362 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	FAM102B	Q5T8I3	360 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	RMDN3	Q96TC7	470 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	FMO2	Q99518	471 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM51	Q9NW97	253 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CYP26A1	O43174	497 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	NPTX2	P47972	431 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	MARCKSL1	P49006	195 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	FMO1	Q01740	532 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	AADACL2	Q6P093	401 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	JAML	Q86YT9	394 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	GLG1	Q92896	1179 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CD101	Q93033	1021 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	GINM1	Q9NU53	330 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	PNMA2	Q9UL42	364 aa		18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	PHF2	O75151	1096 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	COMT	P21964	271 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	CTNNA2	P26232	953 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	PTGIR	P43119	386 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	GPC3	P51654	580 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	KRT39	Q6A163	491 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	ANO5	Q75V66	913 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	SLC47A2	Q86VL8	602 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	PRELID2	Q8N945	189 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	RDM1	Q8NG50	284 aa		18.23	■□□□□ 0.51
TOM1-210	ENST00000449058	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		18.23	■□□□□ 0.51

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