RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-208ENST00000436673 TXKP42681 527 aa29.41■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 CAPSQ13938 189 aa29.41■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 CPB2Q96IY4 423 aa29.41■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 KLHL5Q96PQ7 755 aa29.41■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa29.41■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 RNF39Q9H2S5 420 aa29.41■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.41■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP29.4■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 CNPP09543 421 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 RARRES1P49788 294 aa29.4■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 FOSBP53539 338 aa29.4■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 MBTD1Q05BQ5 628 aa29.4■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP29.4■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 TRIM29Q14134 588 aa29.4■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 AMHR2Q16671 573 aa29.4■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 PRRX2Q99811 253 aa29.4■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 CSRNP2Q9H175 543 aa29.4■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 SORCS3Q9UPU3 1222 aa29.4■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 ARL5CA6NH57 179 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 KLRC2P26717 231 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 CLCN4P51793 760 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 NEK4P51957 841 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 MTMR3Q13615 1198 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 TMC5Q6UXY8 1006 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 COLGALT2Q8IYK4 626 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 FEZF2Q8TBJ5 459 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 GAD1Q99259 594 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 NFKBIZQ9BYH8 718 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 SFXN1Q9H9B4 322 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 MARCH5Q9NX47 278 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 HES2Q9Y543 173 aa29.39■■■□□ 2.3
UPP1-208ENST00000436673 GLRA2P23416 452 aa29.38■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 MLH1P40692 756 aa29.38■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 PTPN5P54829 565 aa29.38■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 VCPP55072 806 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 UBALD2Q8IYN6 164 aa29.38■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa29.38■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 PIGOQ8TEQ8 1089 aa29.38■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 USTQ9Y2C2 406 aa29.38■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 BRD1O95696 1058 aa29.37■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 SOD2P04179 222 aa29.37■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 DSC1Q08554 894 aa29.37■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 ST3GAL1Q11201 340 aa29.37■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 GPR149Q86SP6 731 aa29.37■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 ZFP42Q96MM3 310 aa29.37■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 TMEM60Q9H2L4 133 aa29.37■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 MIOSQ9NXC5 875 aa29.37■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 A0A087WWV3 80 aa29.36■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 EFEMP2O95967 443 aa29.36■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP29.36■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 AVPR2P30518 371 aa29.36■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 OR1G1P47890 313 aa29.36■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 TCF15Q12870 199 aa29.36■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 TAS1R1Q7RTX1 841 aa29.36■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa29.36■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 GIT1Q9Y2X7 761 aa29.36■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 KMT2EQ8IZD2 1858 aa29.36■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 POTEMA6NI47 508 aa29.35■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 B4GALT5O43286 388 aa29.35■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 URODP06132 367 aa29.35■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa29.35■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 SCNN1GP51170 649 aa29.35■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 PLCD3Q8N3E9 789 aa29.35■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 RPS6KC1Q96S38 1066 aa29.35■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 LIMD1Q9UGP4 676 aa29.35■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 C2CD2LO14523 706 aa29.34■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 ASGR2P07307 311 aa29.34■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 PHOX2BQ99453 314 aa29.34■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 APOL6Q9BWW8 343 aa29.34■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 SMOC2Q9H3U7 446 aa29.34■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa29.34■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 SPDYE4A6NLX3 237 aa29.33■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 USO1O60763 962 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 MCM7P33993 719 aa29.33■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 HACE1Q8IYU2 909 aa29.33■■■□□ 2.29
UPP1-208ENST00000436673 F8W810 466 aa29.32■■■□□ 2.28
UPP1-208ENST00000436673 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
UPP1-208ENST00000436673 ATP2B1P20020 1258 aa29.32■■■□□ 2.28
UPP1-208ENST00000436673 KIAA0319Q5VV43 1072 aa29.32■■■□□ 2.28
UPP1-208ENST00000436673 SLC27A1Q6PCB7 646 aa29.32■■■□□ 2.28
UPP1-208ENST00000436673 CATSPER3Q86XQ3 398 aa29.32■■■□□ 2.28
UPP1-208ENST00000436673 GSTCDQ8NEC7 633 aa29.32■■■□□ 2.28
UPP1-208ENST00000436673 TUFT1Q9NNX1 390 aa29.32■■■□□ 2.28
UPP1-208ENST00000436673 GPRC5CQ9NQ84 441 aa29.32■■■□□ 2.28
UPP1-208ENST00000436673 A0A1B0GUA9 196 aa29.31■■■□□ 2.28
UPP1-208ENST00000436673 TEX28O15482 410 aa29.31■■■□□ 2.28
UPP1-208ENST00000436673 NR1I2O75469 434 aa29.31■■■□□ 2.28
UPP1-208ENST00000436673 ADH1AP07327 375 aa29.31■■■□□ 2.28
UPP1-208ENST00000436673 AKAP5P24588 427 aa29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms