RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ITGA4P13612 1032 aa27.54■■■□□ 2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLS3P13797 630 aa27.54■■■□□ 2
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP27.54■■■□□ 2
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP27.54■■■□□ 2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LMAN2LQ9H0V9 348 aa27.54■■■□□ 2
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC16A4O15374 487 aa27.53■■■□□ 2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 B4GALT3O60512 393 aa27.53■■■□□ 2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FGF18O76093 207 aa27.53■■■□□ 2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 EEF1DP3Q658K8 133 aa27.53■■■□□ 2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KCNT2Q6UVM3 1135 aa27.53■■■□□ 2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPIRE2Q8WWL2 714 aa27.53■■■□□ 2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RSPH1Q8WYR4 309 aa27.53■■■□□ 2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CSPG5O95196 566 aa27.52■■■□□ 2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GIT2Q14161 759 aa27.52■■■□□ 2
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF280BQ86YH2 543 aa27.52■■■□□ 2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 POF1BQ8WVV4 589 aa27.52■■■□□ 2
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM134Q9H6X4 195 aa27.52■■■□□ 2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ODF2LQ9ULJ1 636 aa27.52■■■□□ 2
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 TXLNAP40222 546 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BCAR1P56945 870 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BECN1Q14457 450 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 THNSL1Q8IYQ7 743 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHAMP1Q96JM3 812 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF558Q96NG5 402 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBN1Q9NPG3 1134 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STK17AQ9UEE5 414 aa27.51■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARL5CA6NH57 179 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IRS1P35568 1242 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MLH1P40692 756 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF131P52739 623 aa27.5■■□□□ 1.99
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TIGD5Q53EQ6 642 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATF7IP2Q5U623 682 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATL3Q6DD88 541 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZFP42Q96MM3 310 aa27.5■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GAD1Q99259 594 aa27.5■■□□□ 1.99
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC39A11Q8N1S5 342 aa27.49■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GSTCDQ8NEC7 633 aa27.49■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 URGCPQ8TCY9 931 aa27.49■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa27.49■■□□□ 1.99
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP27.48■■□□□ 1.99
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCDHA7Q9UN72 937 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNFSF13BQ9Y275 285 aa27.48■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYO7AQ13402 2215 aa27.48■■□□□ 1.99
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa27.47■■□□□ 1.99
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SMTNP53814 917 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NCKAP1LP55160 1127 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERVFC1P60507 584 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 UBE3AQ05086 875 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PDILTQ8N807 584 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FIZ1Q96SL8 496 aa27.47■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP27.47■■□□□ 1.99
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLK14Q9P0G3 267 aa27.47■■□□□ 1.99
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