RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF699Q32M78 642 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ERFEQ4G0M1 354 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TTLL11Q8NHH1 800 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PDLIM2Q96JY6 352 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 OLFM3Q96PB7 478 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 IRAK4Q9NWZ3 460 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX33O43247 280 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 MARK3P27448 753 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 KRT33BQ14525 404 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 IMPG1Q17R60 797 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 LRRC31Q6UY01 552 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RHOT1Q8IXI2 618 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ICA1LQ8NDH6 482 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RAPGEF5Q92565 580 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 MTRQ99707 1265 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SENP1Q9P0U3 644 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 UBN2Q6ZU65 1347 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 E9PMD0 336 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R37O75864 691 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V1E1P36543 226 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RAP1GDS1P52306 607 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 MTA3Q9BTC8 594 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TEX12Q9BXU0 123 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 EPC1Q9H2F5 836 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SEL1LQ9UBV2 794 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC9A2Q9UBY0 812 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 MRFAP1Q9Y605 127 aa11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PFASO15067 1338 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBTB5O15062 677 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 NCK2O43639 380 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RAD17O75943 681 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 HDAC4P56524 1084 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ACTR2P61160 394 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ZBED8Q8IZ13 594 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 WWP1Q9H0M0 922 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 FBXL5Q9UKA1 691 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 GH2P01242 217 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SERPINB4P48594 390 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 COASYQ13057 564 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RFFLQ8WZ73 363 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM167AQ96KS9 214 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RMDN3Q96TC7 470 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM47Q9BQJ4 181 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 NUP85Q9BW27 656 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC13A1Q9BZW2 595 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 HDAC6Q9UBN7 1215 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF9O43307 516 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 HUS1O60921 280 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 DNAJC6O75061 913 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PYGLP06737 847 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 MCAMP43121 646 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 NEK2P51955 445 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 SEMA3FQ13275 785 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PTK2BQ14289 1009 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 MIGA2Q7L4E1 593 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ARMC2Q8NEN0 867 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 OR6P1Q8NGX9 317 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM213AQ9BRX8 229 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D22BQ9NU19 505 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.66□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1W2PQC6 194 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TMCC1O94876 653 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 ESRRBO95718 433 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 HLA-DPA1P20036 260 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 RCAN1P53805 252 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 PRAMEP78395 509 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 MTMR1Q13613 665 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 TXNRD1Q16881 649 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 GLYCTKQ8IVS8 523 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L15C9J2P7 530 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L13C9JLJ4 530 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L11C9JVI0 530 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L18D6R9N7 530 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L22D6RA61 530 aa11.65□□□□□ -0.54
EFTUD2-202ENST00000426333 USP17L17D6RBQ6 530 aa11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms