RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421185.1

RTCA-AS1-201, RTCA antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RTCA-AS1, Length 423 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTCA-AS1-201ENST00000421185 COL4A3Q01955 1670 aa9.74□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DDHD2O94830 711 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCDC192P0DO97 292 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DARSP14868 501 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HOXA9P31269 272 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NTHL1P78549 312 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FGD1P98174 961 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CDC42EP1Q00587 391 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PTGDRQ13258 359 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GAS6Q14393 721 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LIN9Q5TKA1 542 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KIAA1211LQ6NV74 962 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 USP17L6PQ6QN14 398 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TAS1R1Q7RTX1 841 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KBTBD6Q86V97 674 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LPPQ93052 612 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SCLT1Q96NL6 688 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SMOC1Q9H4F8 434 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TMEM9BQ9NQ34 198 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SCUBE2Q9NQ36 999 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MAD2L2Q9UI95 211 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FREM2Q5SZK8 3169 aa9.73□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZBTB42B2RXF5 422 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MEIS2O14770 477 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NR1I2O75469 434 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CAVIN2O95810 425 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 POU2F2P09086 479 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MS4A1P11836 297 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PLA2G2AP14555 144 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 DGKKQ5KSL6 1271 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PPM1LQ5SGD2 360 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 NPAS3Q8IXF0 933 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CKAP2LQ8IYA6 745 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ITFG1Q8TB96 612 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MSANTD3Q96H12 275 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LRIG1Q96JA1 1093 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MBOAT7Q96N66 472 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF302Q9NR11 478 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KCNH7Q9NS40 1196 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CHST7Q9NS84 486 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 POLIQ9UNA4 740 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PIAS3Q9Y6X2 628 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TTC41PQ6P2S7 1318 aa9.72□□□□□ -0.85
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF213O14771 459 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RHOBTB1O94844 696 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CLCN3P51790 818 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SCAPQ12770 1279 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ELF2Q15723 593 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 USP41Q3LFD5 358 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LONRF3Q496Y0 759 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TCEAL6Q6IPX3 200 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EFCAB12Q6NXP0 572 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ABHD15Q6UXT9 468 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TCEAL3Q969E4 200 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 UBAC1Q9BSL1 405 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZFP14Q9HCL3 533 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 ZSWIM5Q9P217 1185 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RAI2Q9Y5P3 530 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MYO18BQ8IUG5 2567 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa9.71□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 LAMA1P25391 3075 aa9.7□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 B4GALT3O60512 393 aa9.7□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 EFEMP2O95967 443 aa9.7□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 FGFR4P22455 802 aa9.7□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP9.7□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 CCNE1P24864 410 aa9.7□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 OR1G1P47890 313 aa9.7□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 GPC3P51654 580 aa9.7□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 UVSSAQ2YD98 709 aa9.7□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa9.7□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 TANGO2Q6ICL3 276 aa9.7□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.7□□□□□ -0.86
RTCA-AS1-201ENST00000421185 RTL10Q7L3V2 364 aa9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms