RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2CD2LO14523 706 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBX3O15119 743 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERLIN2O94905 339 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADH1AP07327 375 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ITGA4P13612 1032 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AOC1P19801 751 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AK2P54819 239 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EPHA7Q15375 998 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTRQ99707 1265 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNK12Q9HB15 430 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IPPQ9Y573 584 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INPPL1O15357 1258 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASAP2O43150 1006 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSPAN1O60635 241 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPR3P17342 541 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MLH1P40692 756 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR1G1P47890 313 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLUD2P49448 558 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FRMD5Q7Z6J6 570 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAS1Q92839 578 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC51Q96ER9 411 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RGL1Q9NZL6 768 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DPP7Q9UHL4 492 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.69□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STK36Q9NRP7 1315 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARL5CA6NH57 179 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEX28O15482 410 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDKL5O76039 1030 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GLUD1P00367 558 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AXLP30530 894 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DSC1Q08554 894 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XKR9Q5GH70 373 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOTUMQ6P988 496 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIX5Q8N196 739 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYDC2Q96IM9 177 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GAD1Q99259 594 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RTP3Q9BQQ7 232 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLUHO75153 1309 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PI15O43692 258 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MARCH6O60337 910 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EFEMP2O95967 443 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XBP1P17861 261 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCNN1GP51170 649 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTENP60484 403 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP4A11Q02928 519 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPIRE1Q08AE8 756 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCRN1Q12765 414 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA0319Q5VV43 1072 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP26C1Q6V0L0 522 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAMQ92783 540 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPB2Q96IY4 423 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HES2Q9Y543 173 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM186AA6NE01 2351 aa14.67□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F8W810 466 aa14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZBTB39O15060 712 aa14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFPL2O75678 378 aa14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DSG1Q02413 1049 aa14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TFDP1Q14186 410 aa14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OXER1Q8TDS5 423 aa14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFP42Q96MM3 310 aa14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CSRNP2Q9H175 543 aa14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.66□□□□□ -0.06
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms