RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420504.2

TMEM200B-201, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-201ENST00000420504 TMEM206Q9H813 350 aa23.28■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 SEMA4AQ9H3S1 761 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC169A6NNP5 214 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 PODXLO00592 558 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 SGPL1O95470 568 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 MAPTP10636 758 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 ITGB5P18084 799 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 CHMP6Q96FZ7 201 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
TMEM200B-201ENST00000420504 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 GGPS1O95749 300 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 PYGMP11217 842 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 CHN1P15882 459 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 GBP1P32455 592 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 CDR1P51861 262 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 MESDQ14696 234 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 CYP1B1Q16678 543 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 CPLX4Q7Z7G2 160 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 GZMAP12544 262 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 ALCAMQ13740 583 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM71AQ8IYT1 594 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 TRPC6Q9Y210 931 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 USP20Q9Y2K6 914 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 AFF2P51816 1311 aa23.26■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 MMP10P09238 476 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 ACCSQ96QU6 501 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 WNT8AQ9H1J5 351 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 SLC40A1Q9NP59 571 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 HSPBP1Q9NZL4 362 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 SEL1L2Q5TEA6 688 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 CPNE8Q86YQ8 564 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 XXYLT1Q8NBI6 393 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 MORC4Q8TE76 937 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 KREMEN1Q96MU8 473 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 KLC4Q9NSK0 619 aa23.25■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 LDHDQ86WU2 507 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 CCT6BQ92526 530 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 TMEM109Q9BVC6 243 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 AZI2Q9H6S1 392 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 YY1AP1Q9H869 796 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 ACP6Q9NPH0 428 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 PARP2Q9UGN5 583 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 TLDC2A0PJX2 215 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 PMM2O15305 246 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC114Q96M63 670 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 DEFB129Q9H1M3 183 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 CD248Q9HCU0 757 aa23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKRD63C9JTQ0 380 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 MAPK13O15264 365 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 DHX15O43143 795 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 MMEP08473 750 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 PLS3P13797 630 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 RARRES1P49788 294 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 MXI1P50539 228 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 KCNH7Q9NS40 1196 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 COILP38432 576 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 SLC47A2Q86VL8 602 aa23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 CYP26A1O43174 497 aa23.22■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 PLA2G6O60733 806 aa23.22■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 ADRB2P07550 413 aa23.22■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 GTF2BQ00403 316 aa23.22■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 FMO1Q01740 532 aa23.22■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 ADCY2Q08462 1091 aa23.22■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 AOC3Q16853 763 aa23.22■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 C6orf118Q5T5N4 469 aa23.22■■□□□ 1.31
TMEM200B-201ENST00000420504 P3H4Q92791 437 aa23.22■■□□□ 1.31
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