RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 KCND2Q9NZV8 630 aa22.79■■□□□ 1.24
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PTPRJ-201ENST00000418331 SPATA4Q8NEY3 305 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRJ-201ENST00000418331 TTC17Q96AE7 1141 aa22.78■■□□□ 1.24
PTPRJ-201ENST00000418331 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
PTPRJ-201ENST00000418331 KLRK1P26718 216 aa22.78■■□□□ 1.24
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PTPRJ-201ENST00000418331 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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PTPRJ-201ENST00000418331 BNIP3LO60238 219 aa22.77■■□□□ 1.24
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PTPRJ-201ENST00000418331 STYK1Q6J9G0 422 aa22.76■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 TERF2Q15554 542 aa22.75■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.75■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 CLGNO14967 610 aa22.74■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
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PTPRJ-201ENST00000418331 KCNB2Q92953 911 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 AMACRQ9UHK6 382 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 KIF3CO14782 793 aa22.74■■□□□ 1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 HSPA4LO95757 839 aa22.74■■□□□ 1.23
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