RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 VPS53Q5VIR6 699 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 KCNT2Q6UVM3 1135 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 HOMER1Q86YM7 354 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 LRRC43Q8N309 656 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 VN1R2Q8NFZ6 395 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 NXPE3Q969Y0 559 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 TMEM169Q96HH4 297 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 SHDQ96IW2 340 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 ADAM2Q99965 735 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 KRT23Q9C075 422 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 TMEM117Q9H0C3 514 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 RGS18Q9NS28 235 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 TMEM161AQ9NX61 479 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 WNT16Q9UBV4 365 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 DUSP12Q9UNI6 340 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 SIT1Q9Y3P8 196 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 R4GN57 208 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.99□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 ZMYM6O95789 1325 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 MAFGO15525 162 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 INSRRP14616 1297 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 MX1P20591 662 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 TMEM62Q0P6H9 643 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 HIF1AQ16665 826 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 BTLAQ7Z6A9 289 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 C1orf210Q8IVY1 113 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 IL31RAQ8NI17 732 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 SDF4Q9BRK5 362 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 RBCK1Q9BYM8 510 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 DCTPP1Q9H773 170 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 HCN2Q9UL51 889 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 RAB23Q9ULC3 237 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 ZNF292O60281 2723 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 CEP250Q9BV73 2442 aa8.98□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 HIDE1A8MVS5 230 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 PI15O43692 258 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 MAPK1P28482 360 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 IDH3AP50213 366 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 GATMP50440 423 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 SLC26A2P50443 739 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 TYRO3Q06418 890 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 TRDNQ13061 729 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 KCNC3Q14003 757 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 DBN1Q16643 649 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 TMEM266Q2M3C6 531 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 SPECC1Q5M775 1068 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 NLRP8Q86W28 1048 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 RSPH1Q8WYR4 309 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 GPRASP2Q96D09 838 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 ASB16Q96NS5 453 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 RTKNQ9BST9 563 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 SFXN1Q9H9B4 322 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 KCNK12Q9HB15 430 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 POLIQ9UNA4 740 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 SPTBN2O15020 2390 aa8.97□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa8.96□□□□□ -0.97
CASP4-201ENST00000393150 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 LAMTOR5O43504 91 aa8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 PDGFAP04085 211 aa8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 MTMR1Q13613 665 aa8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 SART3Q15020 963 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 SAMD5Q5TGI4 173 aa8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 RNF169Q8NCN4 708 aa8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 LINC01599Q8WXQ3 324 aa8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 EDEM1Q92611 657 aa8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 BCO2Q9BYV7 579 aa8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 SMOC2Q9H3U7 446 aa8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.96□□□□□ -0.98
CASP4-201ENST00000393150 USP18Q9UMW8 372 aa8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms