RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 MUTYHQ9UIF7 546 aa28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 C5orf42Q9H799 3197 aa28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 B4GALT3O60512 393 aa28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 DDHD2O94830 711 aa28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 TPRNQ4KMQ1 711 aa28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 GAD1Q99259 594 aa28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 TMEM175Q9BSA9 504 aa28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 LRWD1Q9UFC0 647 aa28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 FAN1Q9Y2M0 1017 aa28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 NPTXRO95502 500 aa28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 ALDH2P05091 517 aa28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 CTSAP10619 480 aa28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 KCNC3Q14003 757 aa28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 AMHR2Q16671 573 aa28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 SLC27A1Q6PCB7 646 aa28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 STK39Q9UEW8 545 aa28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.11
FAAP20-202ENST00000378546 ARL5CA6NH57 179 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 SPDYE4A6NLX3 237 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 PRR33A8MZF0 331 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 LIG1P18858 919 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 OR1G1P47890 313 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 CES5AQ6NT32 575 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 SYCE2Q6PIF2 218 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 DEPTORQ8TB45 409 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 C2orf40Q9H1Z8 148 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 SCNN1GP51170 649 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 PTGDRQ13258 359 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 SNX29Q8TEQ0 813 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 SUSD6Q92537 303 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 ZFP42Q96MM3 310 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 RNF39Q9H2S5 420 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 NRP1O14786 923 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 NR1I2O75469 434 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 CYP11B2P19099 503 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 MUTP22033 750 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 PRIMPOLQ96LW4 560 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 S1PR5Q9H228 398 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 PARP2Q9UGN5 583 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 KIAA1024Q9UPX6 916 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 STK24Q9Y6E0 443 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 LOC730098B7Z3J9 87 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 H3BQV1 296 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 SP100P23497 879 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 AKAP5P24588 427 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 PPP2R5AQ15172 486 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 PTPN14Q15678 1187 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 TMX3Q96JJ7 454 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 RPS6KC1Q96S38 1066 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 VN1R3Q9BXE9 311 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 BHMT2Q9H2M3 363 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 DZANK1Q9NVP4 752 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 GIT1Q9Y2X7 761 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 IRAK3Q9Y616 596 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 URODP06132 367 aa28.16■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 MAPK6Q16659 721 aa28.16■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa28.16■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 C4orf32Q8N8J7 132 aa28.16■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 BSNDQ8WZ55 320 aa28.16■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 IFT74Q96LB3 600 aa28.16■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 A0A1B0GUA9 196 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 LAD1O00515 517 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 C2CD2LO14523 706 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 NAMPTP43490 491 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 ITIH3Q06033 890 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 KRT79Q5XKE5 535 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 PPFIBP1Q86W92 1011 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 COLGALT2Q8IYK4 626 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 KLK14Q9P0G3 267 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 N4BP3O15049 544 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 PRKCBP05771 671 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 EPCAMP16422 314 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 KLRC2P26717 231 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 GJB2P29033 226 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 PDIA5Q14554 519 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 ECM1Q16610 540 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 DTHD1Q6ZMT9 781 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-202ENST00000378546 CABP7Q86V35 215 aa28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms