RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 BCAR1P56945 870 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 SAMD7Q7Z3H4 446 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 PARVAQ9NVD7 372 aa17.39■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC4O95801 387 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 SCYL3Q8IZE3 742 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 RDM1Q8NG50 284 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM143Q96AN5 459 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 RBP5P82980 135 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 RCN2Q14257 317 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 OSBPL9Q96SU4 736 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 FSD1LQ9BXM9 530 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 BAG2O95816 211 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 ADORA2BP29275 332 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.372e-6■□□□□ 10.9
SH3BP4-201ENST00000344528 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 CCL15Q16663 113 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 LRGUKQ96M69 825 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 AGPAT1Q99943 283 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP17.38■□□□□ 0.372e-6■■■□□ 16.7
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEB5Q9BZ81 275 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 APOEP02649 317 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 FDPSP14324 419 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 EMC2Q15006 297 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC144BQ3MJ40 725 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 ATG16L1Q676U5 607 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 ATG4CQ96DT6 458 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 HAUS8Q9BT25 410 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 Q9H521 79 aa17.38■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 MYMKA6NI61 221 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 PRKCEQ02156 737 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 VEPH1Q14D04 833 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 ZDHHC15Q96MV8 337 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 CPB1P15086 417 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 SENP2Q9HC62 589 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 TUBE1Q9UJT0 475 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 CLTAP09496 248 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 IFT88Q13099 833 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 NR1H3Q13133 447 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 TUBB6Q9BUF5 446 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 STK33Q9BYT3 514 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 APEX2Q9UBZ4 518 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1B0GTH6 734 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 CREB3O43889 395 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 CHEK2O96017 543 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 SCP2P22307 547 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 IER5Q5VY09 327 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX2Q8IWB9 1127 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 DAGLBQ8NCG7 672 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 AFG1LQ8WV93 481 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKEF1Q9NU02 776 aa17.37■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 ADGRB1O14514 1584 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 MEGF6O75095 1541 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 SPDYE2BA6NHP3 402 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 SRGAP2O75044 1071 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 SPDYE6P0CI01 402 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 KLRK1P26718 216 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 STK4Q13043 487 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 HPS3Q969F9 1004 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 PGBD4Q96DM1 585 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 H3BRJ5 948 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP120Q8N960 986 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 SH2D3AQ9BRG2 576 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR35Q9P2L0 1181 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 POLLQ9UGP5 575 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 AGAP1Q9UPQ3 857 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM187AA6NFU0 413 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 DPYSL4O14531 572 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 RTN2O75298 545 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 SRGNP10124 158 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 NNMTP40261 264 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 HUNKP57058 714 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 KAZALD1Q96I82 304 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM8A1Q9UBU6 413 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 FMO5P49326 533 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 KLHL38Q2WGJ6 581 aa17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
SH3BP4-201ENST00000344528 GPRASP2Q96D09 838 aa17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms