RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 GINS2Q9Y248 185 aa22.62■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 KBTBD13C9JR72 458 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR32O75388 356 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 TOM1L1O75674 476 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 IQCF3P0C7M6 154 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 CCL5P13501 91 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 PBX1P40424 430 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 MTFR1Q15390 333 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM132AQ24JP5 1023 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 GPD1LQ8N335 351 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 RDH13Q8NBN7 331 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 SAAL1Q96ER3 474 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 DEFB118Q96PH6 123 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF208Q9H0X6 261 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PQC6 194 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 CLDN3O15551 220 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT13P13646 458 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 TCERG1LQ5VWI1 586 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 SERINC5Q86VE9 423 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXL18Q96ME1 805 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A1W2PQY0 241 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 BFSP1Q12934 665 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 RSPH3Q86UC2 560 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC35C1Q96A29 364 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 TCHPQ9BT92 498 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 PHF24Q9UPV7 400 aa22.6■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0B4J269 797 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 DNM1LO00429 736 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 B4GALT5O43286 388 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 EXTL3O43909 919 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 ERLIN2O94905 339 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 LBX1P52954 281 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNH2Q12809 1159 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 PTGISQ16647 500 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 OSMRQ99650 979 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 AFPP02771 609 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 AMHR2Q16671 573 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 ERGIC2Q96RQ1 377 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 TNFSF13BQ9Y275 285 aa22.59■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 ADRB2P07550 413 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 PROZP22891 400 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 MPZL3Q6UWV2 235 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 NOD1Q9Y239 953 aa22.58■■□□□ 1.21
PACSIN3-201ENST00000298838 M0QZ92 97 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 VAMP7P51809 220 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 GSDMDP57764 484 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 MCL1Q07820 350 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 SYCP1Q15431 976 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF568Q3ZCX4 644 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 USP37Q86T82 979 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF233A6NK53 670 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 ABLIM1O14639 778 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 TSPAN1O60635 241 aa22.57■■□□□ 1.2
PACSIN3-201ENST00000298838 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
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