RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 USP31Q70CQ4 1352 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 HAUS6Q7Z4H7 955 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 FSD1LQ9BXM9 530 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 KCNF1Q9H3M0 494 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 BFARQ9NZS9 450 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 M0QYV0 167 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 DPYDQ12882 1025 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 THEM5Q8N1Q8 247 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 REREQ9P2R6 1566 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 AMACRQ9UHK6 382 aa22.46■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 RHOBTB3O94955 611 aa22.45■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 PARVAQ9NVD7 372 aa22.45■■□□□ 1.19
CCSAP-201ENST00000284617 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 MORF4L2Q15014 288 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC1Q9BTT6 524 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 DCTN4Q9UJW0 460 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 RTN2O75298 545 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1R37O75864 691 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ROR1Q01973 937 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 CNPY4Q8N129 248 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 PARD3BQ8TEW8 1205 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 EXT2Q93063 718 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SLC8A2Q9UPR5 921 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SLC26A4O43511 780 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 TIPINQ9BVW5 301 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 GNAT1P11488 350 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 DRP2Q13474 957 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 LCA5Q86VQ0 697 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SAAL1Q96ER3 474 aa22.45■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 FAM196BA6NMK8 535 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ATL2Q8NHH9 583 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 CHGBP05060 677 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 NUDCD3Q8IVD9 361 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ECE2O60344 883 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC22O60826 627 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 NR1I3Q14994 352 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 AP2B1P63010 937 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.185e-7■□□□□ 11.2
CCSAP-201ENST00000284617 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC31Q6UY01 552 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 CHP1Q99653 195 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 L3MBTL1Q9Y468 752 aa22.44■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 GLI2P10070 1586 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF609O15014 1411 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 AGTP01019 485 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF26B4DH59 902 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 CEP55Q53EZ4 464 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 NBPF15Q8N660 670 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 TTC8Q8TAM2 541 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 GTSE1Q9NYZ3 720 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 C21orf2O43822 256 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 NCAPHQ15003 741 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf54Q8WWF1 131 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 NDE1Q9NXR1 346 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 AKR1B1P15121 316 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 KRT17Q04695 432 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 PARP9Q8IXQ6 854 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 STK33Q9BYT3 514 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SMYD3Q9H7B4 428 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ECT2Q9H8V3 914 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.43■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SBK1Q52WX2 424 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 SEPT12Q8IYM1 358 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 ELF1P32519 619 aa22.42■■□□□ 1.18
CCSAP-201ENST00000284617 DUOXA2Q1HG44 320 aa22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms