RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 TTBK2Q6IQ55 1244 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 MTMR8Q96EF0 704 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 ETNK1Q9HBU6 452 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 TXLNGQ9NUQ3 528 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 SBF1O95248 1867 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 GFPT2O94808 682 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 FLT3P36888 993 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 KLHL7Q8IXQ5 586 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 LRRC43Q8N309 656 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 LRMDAQ9H2I8 198 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 STOML1Q9UBI4 398 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 SH3GLB1Q9Y371 365 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 MYH4Q9Y623 1939 aa23.51■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 ATP9AO75110 1047 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 GM2AP17900 193 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 ZNF543Q08ER8 600 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 KCNN1Q92952 543 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 COA7Q96BR5 231 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 ATP5HO75947 161 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 MAGEA1P43355 309 aa23.5■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 ASLP04424 464 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 GSTA3Q16772 222 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 FAM13CQ8NE31 585 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 TMEM237Q96Q45 408 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 CES2O00748 559 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 TNIP1Q15025 636 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 DCLRE1BQ9H816 532 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 TMEM260Q9NX78 707 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 INTUQ9ULD6 942 aa23.49■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 PP2D1A8MPX8 630 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 SLC16A2P36021 539 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 ZNF554Q86TJ5 538 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 OGFOD1Q8N543 542 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 FAM81BQ96LP2 452 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 C6orf50Q9HD87 102 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 HSFX1Q9UBD0 423 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 NUB1Q9Y5A7 615 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 PDXDC2PQ6P474 469 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 KCTD1Q719H9 257 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 DPH5Q9H2P9 285 aa23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 AFPP02771 609 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 ITGA2BP08514 1039 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 NUDT17P0C025 328 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 USH1GQ495M9 461 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 ARL10Q8N8L6 244 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 USP20Q9Y2K6 914 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 GNA11P29992 359 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 SCFD2Q8WU76 684 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 IRGQQ8WZA9 623 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 CCDC17Q96LX7 622 aa23.47■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 AKR1B10O60218 316 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 EGFRP00533 1210 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 LONP1P36776 959 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 LETM2Q2VYF4 491 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 RNF43Q68DV7 783 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 SIAH1Q8IUQ4 282 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 WDR60Q8WVS4 1066 aa23.46■■□□□ 1.35
PITX1-201ENST00000265340 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms