RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261177.9

TSPAN11-201, Transcript of tetraspanin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN11, Length 5,505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11-201ENST00000261177 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 ZNF543Q08ER8 600 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 TTLL4Q14679 1199 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 HAUS6Q7Z4H7 955 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 GLYCTKQ8IVS8 523 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 CNPY4Q8N129 248 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 DTNBP1Q96EV8 351 aa15.76■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 NR1I3Q14994 352 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 GRAMD1AQ96CP6 724 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 CRAMP1Q96RY5 1269 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 KLC4Q9NSK0 619 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 PARVAQ9NVD7 372 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 STAP1Q9ULZ2 295 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 GRAMD1BQ3KR37 738 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 TRIM67Q6ZTA4 783 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 TRIM59Q8IWR1 403 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 EPHB1P54762 984 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 SLC18A3Q16572 532 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 M0QYV0 167 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 KRT14P02533 472 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 SMARCA1P28370 1054 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 EFNA5P52803 228 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 NFIXQ14938 502 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 WDR24Q96S15 920 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 YIPF3Q9GZM5 350 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 USP32Q8NFA0 1604 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 A0A0G2JND7 137 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 RASSF10A6NK89 507 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 UBN1Q9NPG3 1134 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 FIS1Q9Y3D6 152 aa15.75■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 C1orf167Q5SNV9 1468 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 NFKBIAP25963 317 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 FLT1P17948 1338 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 ARHGAP10A1A4S6 786 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 LDHDQ86WU2 507 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 ATP11CQ8NB49 1132 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 STK33Q9BYT3 514 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 NYAP2Q9P242 653 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 ASAP2O43150 1006 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 KCNV1Q6PIU1 500 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 ZFP69BQ9UJL9 534 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 ARPP19P56211 112 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 GRAMD4Q6IC98 578 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 KIF9Q9HAQ2 790 aa15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 TRIM49P0CI25 452 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 TRIM49CP0CI26 452 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 ANTXR2P58335 489 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 EDRF1Q3B7T1 1238 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 NDUFAF2Q8N183 169 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 CHMP6Q96FZ7 201 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 A0A1W2PQJ5 194 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 ROR1Q01973 937 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 MTF1Q14872 753 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 PSD3Q9NYI0 1048 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 SLC9A2Q9UBY0 812 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 ESYT3A0FGR9 886 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 MYL3P08590 195 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 BRAFP15056 766 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 OCA2Q04671 838 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 C16orf86Q6ZW13 317 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 ANLNQ9NQW6 1124 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 HEY1Q9Y5J3 304 aa15.73■□□□□ 0.11
TSPAN11-201ENST00000261177 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms