RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 CMA1P23946 247 aa24.54■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa24.54■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 STAMQ92783 540 aa24.54■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 DHX58Q96C10 678 aa24.54■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 PARVGQ9HBI0 331 aa24.54■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 PTPRHQ9HD43 1115 aa24.54■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.54■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 HPSEQ9Y251 543 aa24.54■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 FAM13AO94988 1023 aa24.53■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 NPTXRO95502 500 aa24.53■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 MYCT1Q8N699 235 aa24.53■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 IQUBQ8NA54 791 aa24.53■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 CNNM3Q8NE01 707 aa24.53■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 GDPD5Q8WTR4 605 aa24.53■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 PGBD4Q96DM1 585 aa24.53■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 FRMD3A2A2Y4 597 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 H3BNC9 293 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 ABLIM1O14639 778 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 N4BP3O15049 544 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 TRAK2O60296 914 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 KRT18P05783 430 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 SMTNP53814 917 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 FBXO22Q8NEZ5 403 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 CUEDC2Q9H467 287 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 TNFSF13BQ9Y275 285 aa24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GVL5 298 aa24.51■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 RB1P06400 928 aa24.51■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 PROZP22891 400 aa24.51■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 NMT1P30419 496 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ATF7IP2Q5U623 682 aa24.51■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 TNMDQ9H2S6 317 aa24.51■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 RSAD1Q9HA92 442 aa24.51■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 MTCH2Q9Y6C9 303 aa24.51■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa24.51■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 INPPL1O15357 1258 aa24.5■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 B4GALT3O60512 393 aa24.5■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ITGA4P13612 1032 aa24.5■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 FOSL2P15408 326 aa24.5■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 PFKFB1P16118 471 aa24.5■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 CTNNB1P35222 781 aa24.5■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 GSTCDQ8NEC7 633 aa24.5■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 STRA6Q9BX79 667 aa24.5■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 MIOSQ9NXC5 875 aa24.5■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 RWDD3Q9Y3V2 267 aa24.5■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQ27 194 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQ64 194 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PQD8 194 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 TBCAO75347 108 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 AKAP5P24588 427 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 GTF2BQ00403 316 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 NOMO2Q5JPE7 1267 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 CNNM4Q6P4Q7 775 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 GLB1LQ6UWU2 654 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 SFR1Q86XK3 245 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ABI1Q8IZP0 508 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 LRRC43Q8N309 656 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 PLVAPQ9BX97 442 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 TRIM9Q9C026 710 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 CXCL16Q9H2A7 254 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 TBC1D13Q9NVG8 400 aa24.49■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 GPM6BQ13491 265 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 CAMK1Q14012 370 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ZNF720Q7Z2F6 126 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 FAM178BQ8IXR5 827 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 P2RX5Q93086 422 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 GAD1Q99259 594 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 UBN1Q9NPG3 1134 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 TBX20Q9UMR3 447 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 PLAGL2Q9UPG8 496 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 GIT1Q9Y2X7 761 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 MYO7AQ13402 2215 aa24.48■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ARL5CA6NH57 179 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 GRM6O15303 877 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R37O75864 691 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 ITGB1P05556 798 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 IGFBP4P22692 258 aa24.47■■□□□ 1.51
SYF2-201ENST00000236273 CASP1P29466 404 aa24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms