RNA–Protein interactions for RNA: YMR033W

ARP9, Transcript of Component of both the SWI/SNF and RSC chromatin remodeling complexes, yeast

Gene ARP9, Length 1,404 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ARP9	YMR033W	MIC19	P43594	170 aa		2.71	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	MND1	P53102	219 aa		2.71	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	YPL077C	Q02831	240 aa		2.71	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	GMC1	Q04399	608 aa		2.71	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	ASR1	Q06834	288 aa		2.71	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	LAG2	Q92325	660 aa		2.71	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	IFM1	P25038	676 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	RRG9	P40156	214 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	SLM1	P40485	686 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	YIL054W	P40524	105 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	UFE1	P41834	346 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	MRX8	Q05473	314 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	YOR292C	Q08743	309 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	YPR064W	Q12492	139 aa		2.7	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	ATP6	P00854	259 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	RPC37	P36121	282 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	GDS1	P41913	522 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	GPN3	Q06543	272 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	YDL012C	Q12489	107 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	FMP16	Q12497	93 aa		2.69	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	CKA2	P19454	339 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	COX10	P21592	462 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	TPO5	P36029	618 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	YIA6	P40556	373 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	YGL118C	P53132	145 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	VTI1	Q04338	217 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	ECM19	Q06011	112 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	POM33	Q12164	279 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	TRM10	Q12400	293 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	MRPL6	P32904	214 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	FRT2	P39734	528 aa		2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	TFS1	P14306	219 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	YSR3	P23501	404 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	RIB7	P33312	244 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	GPX1	P36014	167 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	YBR062C	P38239	180 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	BDH1	P39714	382 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	VAB2	P40003	282 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	MRX5	P47007	382 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	PEX30	Q06169	523 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	TAZ1	Q06510	381 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	YPL278C	Q08990	100 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	YDL211C	Q12121	372 aa		2.67	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	AIM29	P36154	155 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	FRM2	P37261	193 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	TRR2	P38816	342 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	CAX4	P53223	239 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	IES4	Q08561	116 aa		2.66	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
ARP9	YMR033W	RPB9	P27999	122 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	MRPL37	P36532	105 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	YFL064C	P43540	174 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	ASG7	P46993	209 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	FMP33	P46998	180 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	RPN14	P53196	417 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	CPD1	P53314	239 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	HST4	P53688	370 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	YMR209C	Q03648	457 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	DPP1	Q05521	289 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	FAB1	P34756	2278 aa		2.65	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	DAL5	P15365	543 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	CPT1	P17898	393 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	DAL81	P21657	970 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	VPH2	P32341	215 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	YIR035C	P40579	254 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	SPP2	Q02521	185 aa		2.64	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	CUP2	P15315	225 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	IMP1	P28627	190 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	AEP1	P32493	518 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	KRE29	P40026	464 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	YIL012W	P40551	113 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	LIF1	P53150	421 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	TAF9	Q05027	157 aa		2.63	□□□□□ -1.99
ARP9	YMR033W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99

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