RNA–Protein interactions for RNA: YLR369W

SSQ1, Transcript of Mitochondrial hsp70-type molecular chaperone, yeastyeast

Gene SSQ1, Length 1,974 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSQ1YLR369W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W FMP40Q08968 688 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RTR2Q12378 196 aa1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RRP36Q12481 300 aaPredicted RBP1.87□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W REP1P03871 373 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W CDC31P06704 161 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W CMD1P06787 147 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W GPA2P10823 449 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W CBS1P14066 229 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W PET123P17558 318 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W DAL80P26343 269 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ITR1P30605 584 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RIM1P32445 135 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W CYS4P32582 507 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W GCG1P32656 232 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MRPL39P36533 70 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SRO77P38163 1010 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W PHO90P39535 881 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W HXT9P40885 567 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W IDP2P41939 412 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YFR054CP43622 192 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W FAR3P46671 204 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YPT32P51996 222 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SBH2P52871 88 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RBG2P53295 368 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MTQ1P53944 314 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RSM23Q01163 450 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W NCE101Q02820 53 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RNY1Q02933 434 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W EKI1Q03764 534 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YDR249CQ03787 373 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YMR114CQ04471 368 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W VPS38Q05919 439 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YLR177WQ06251 628 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YLR036CQ07986 203 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W PSY3Q12318 242 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YCL012CQ8J0M4 134 aa1.86□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W PUT2P07275 575 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MRP13P12686 339 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SPO7P18410 259 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RPB5P20434 215 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W BOS1P25385 244 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SSE2P32590 693 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ARC19P33204 171 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RPL32P38061 130 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ECM14P38836 430 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SHO1P40073 367 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MET18P40469 1032 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W AYR1P40471 297 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SGN1P40561 250 aaKnown RBP RIP-Chip data1.85□□□□□ -2.11not detected
SSQ1YLR369W GCD10P41814 478 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W TAF6P53040 516 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YNL140CP53910 189 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SLT2Q00772 484 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SKO1Q02100 647 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RMI1Q02685 241 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W BUR2Q05949 395 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SET6Q12529 373 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YJR112W-AQ3E743 109 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YBR298C-AQ8TGK4 73 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YPT6Q99260 215 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ARG3P05150 338 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W HEM2P05373 342 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W DST1P07273 309 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W PET494P07390 489 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data1.85□□□□□ -2.11not detected
SSQ1YLR369W PDX1P16451 410 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W UTR1P21373 530 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W BUD5P25300 642 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W CDC10P25342 322 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W OCA4P25366 362 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W PBN1P25580 416 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YBR144CP34215 104 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MRPL10P36520 322 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RIM2P38127 377 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ROT2P38138 954 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YHL044WP38727 235 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W NSG1P38837 291 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W ATG7P38862 630 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W AIM2P39721 246 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W EGT2P42835 1041 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W APT1P49435 187 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W IMD4P50094 524 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W PKP2P53170 491 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W EFM5P53200 248 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W RHO5P53879 331 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W MET31Q03081 177 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W INP1Q03694 420 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SNX41Q04053 625 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W HPT1Q04178 221 aaKnown RBP1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W GRE1Q08969 168 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YPR202WQ08993 238 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W BSC1Q12140 328 aa1.85□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W CKI1P20485 582 aa1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SCO1P23833 295 aa1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W YCR090CP25654 182 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
SSQ1YLR369W SSE1P32589 693 aaKnown RBP1.84□□□□□ -2.11
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