RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635865.1

ATRX-220, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-220ENST00000635865 F5H0A9 414 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 H3BUI4 141 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 MAN2B1O00754 1011 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 NPHS1O60500 1241 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CKMT1AP12532 417 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 DRD2P14416 443 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 EDNRBP24530 442 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 OAS2P29728 719 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 SLC7A1P30825 629 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 WASP42768 502 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 KIR3DL1P43629 444 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 MAP2K6P52564 334 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 RAB1AP62820 205 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ZBED6P86452 979 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CDK17Q00537 523 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 FMO1Q01740 532 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 PFKPQ01813 784 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ROR1Q01973 937 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 PMS2P11Q13670 270 aa2.89□□□□□ -1.95
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ATRX-220ENST00000635865 PLCB4Q15147 1175 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CNGA2Q16280 664 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ADCK5Q3MIX3 580 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 FIGNQ5HY92 759 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 PITRM1Q5JRX3 1037 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CPZQ66K79 652 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 KLHDC10Q6PID8 442 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 LMBR1LQ6UX01 489 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CEP68Q76N32 757 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TMC6Q7Z403 805 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CPNE8Q86YQ8 564 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TMTC1Q8IUR5 882 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 NOSTRINQ8IVI9 506 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 POU5F2Q8N7G0 328 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 C7orf31Q8N865 590 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 RNF152Q8N8N0 203 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ATP11CQ8NB49 1132 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 DTWD2Q8NBA8 298 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 UCMAQ8WVF2 138 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 NRG4Q8WWG1 115 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 RSAD2Q8WXG1 361 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 RUBCNQ92622 972 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ANKS1AQ92625 1134 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 MUL1Q969V5 352 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ATP6V1E2Q96A05 226 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 RGMAQ96B86 450 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 SUCLG2Q96I99 432 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 PKNOX2Q96KN3 472 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TIGD1Q96MW7 591 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 NELL2Q99435 816 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 SDF4Q9BRK5 362 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
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ATRX-220ENST00000635865 STK31Q9BXU1 1019 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 STK33Q9BYT3 514 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CCDC68Q9H2F9 335 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CDIP1Q9H305 208 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CNTD2Q9H8S5 307 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ARMT1Q9H993 441 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 OBP2BQ9NPH6 170 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 VPS45Q9NRW7 570 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 KCNK4Q9NYG8 393 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 GGA3Q9NZ52 723 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 KIF17Q9P2E2 1029 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 AASSQ9UDR5 926 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 DPP7Q9UHL4 492 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 DSEQ9UL01 958 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 SRPK3Q9UPE1 567 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 JAG2Q9Y219 1238 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ATP23Q9Y6H3 246 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 NUMBLQ9Y6R0 609 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 USP19O94966 1318 aa2.89□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa2.88□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa2.88□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa2.88□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 LGALS16A8MUM7 142 aa2.88□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 B4DLN1 442 aa2.88□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 DLL1O00548 723 aa2.88□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TOR1BO14657 336 aa2.88□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 NPC1O15118 1278 aa2.88□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP2.88□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 SOAT2O75908 522 aa2.88□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 DGKIO75912 1065 aa2.88□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 APOL3O95236 402 aa2.88□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 CBX7O95931 251 aa2.88□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 TMEM253P0C7T8 217 aa2.88□□□□□ -1.95
ATRX-220ENST00000635865 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
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