RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 POMCP01189 267 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 MYBP10242 640 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM175Q9BSA9 504 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 KANSL3Q9P2N6 904 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa30.66■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 NRP1O14786 923 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 PSMC5P62195 406 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC7A3Q8WY07 619 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 STAMQ92783 540 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa30.65■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 ADH1AP07327 375 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 CCT2P78371 535 aaKnown RBP30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 ANO5Q75V66 913 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 SKAP1Q86WV1 359 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 RSAD2Q8WXG1 361 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa30.64■■■□□ 2.5
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC45O75419 566 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 SOD2P04179 222 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNAR1P17181 557 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 OR1G1P47890 313 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 NTRK3Q16288 839 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 IFT122Q9HBG6 1241 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 SH3GLB2Q9NR46 395 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 DPP7Q9UHL4 492 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 CA14Q9ULX7 337 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa30.63■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 INPPL1O15357 1258 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 LILRB3O75022 631 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 GLUD1P00367 558 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 NPEPPSP55786 919 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM22Q8IYM9 498 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS6KC1Q96S38 1066 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHA4Q9UN74 947 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 CLUHO75153 1309 aa30.62■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 DENND4AQ7Z401 1863 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 B3GNT9Q6UX72 402 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 ETNPPLQ8TBG4 499 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM143Q96AN5 459 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 CEP170P1Q96L14 293 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 WNT16Q9UBV4 365 aa30.61■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 TEX28O15482 410 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGA4P13612 1032 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 GLUD2P49448 558 aa30.6■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa30.6■■■□□ 2.49
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CAPNS1-217ENST00000629983 PIDD1Q9HB75 910 aa30.6■■■□□ 2.49
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CAPNS1-217ENST00000629983 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS6KB1P23443 525 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 CYP3A7P24462 503 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 QARSP47897 775 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 SPECC1Q5M775 1068 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 UBXN11Q5T124 520 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS1R1Q7RTX1 841 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 BLIDQ8IZY5 108 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 MINDY3Q9H8M7 445 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 TBC1D17Q9HA65 648 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 MARCH5Q9NX47 278 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX14Q9Y5W7 946 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 DMDP11532 3685 aa30.59■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 KRBA1A5PL33 1030 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 RFPL2O75678 378 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 ERLIN2O94905 339 aa30.58■■■□□ 2.49
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CAPNS1-217ENST00000629983 MYADMQ96S97 322 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 UBN1Q9NPG3 1134 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 R4GN57 208 aa30.58■■■□□ 2.49
CAPNS1-217ENST00000629983 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 EML1O00423 815 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA31D3P0C874 917 aa30.57■■■□□ 2.48
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CAPNS1-217ENST00000629983 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC44A3Q8N4M1 653 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
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CAPNS1-217ENST00000629983 HINFPQ9BQA5 517 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 EPS15L1Q9UBC2 864 aa30.57■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR81Q562E7 1941 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 NR1I2O75469 434 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 SRFP11831 508 aa30.56■■■□□ 2.48
CAPNS1-217ENST00000629983 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
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