RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 TSC1Q92574 1164 aa23.64■■□□□ 1.37
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SGMS1-210ENST00000619438 DNM2P50570 870 aa23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 IKBKEQ14164 716 aa23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 MBTPS1Q14703 1052 aa23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 IER5Q5VY09 327 aa23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 RPAINQ86UA6 219 aa23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 STK24Q9Y6E0 443 aa23.63■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 COL1A2P08123 1366 aa23.62■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 M0QZ92 97 aa23.62■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 OATP04181 439 aa23.62■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 UBXN1Q04323 297 aa23.62■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 PPP2R5CQ13362 524 aa23.62■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD40Q6AI12 368 aa23.62■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.62■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 TMTC1Q8IUR5 882 aa23.62■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa23.61■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF862O60290 1169 aa23.61■■□□□ 1.37
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SGMS1-210ENST00000619438 UGCGQ16739 394 aa23.61■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.61■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 KCNK18Q7Z418 384 aa23.61■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 METTL13Q8N6R0 699 aa23.61■■□□□ 1.37
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SGMS1-210ENST00000619438 VAV3Q9UKW4 847 aa23.61■■□□□ 1.37
SGMS1-210ENST00000619438 TET1Q8NFU7 2136 aa23.61■■□□□ 1.37
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SGMS1-210ENST00000619438 BANK1Q8NDB2 785 aa23.6■■□□□ 1.37
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SGMS1-210ENST00000619438 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.6■■□□□ 1.37
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SGMS1-210ENST00000619438 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.6■■□□□ 1.37
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SGMS1-210ENST00000619438 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.6■■□□□ 1.37
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SGMS1-210ENST00000619438 FAM161BQ96MY7 647 aa23.59■■□□□ 1.37
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SGMS1-210ENST00000619438 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa23.57■■□□□ 1.36
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SGMS1-210ENST00000619438 HAUS3Q68CZ6 603 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.57■■□□□ 1.36
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SGMS1-210ENST00000619438 CAPN11Q9UMQ6 739 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 KRT9P35527 623 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 RABGGTBP53611 331 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 MTF1Q14872 753 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 RAB30Q15771 203 aa23.57■■□□□ 1.36
SGMS1-210ENST00000619438 MTERF2Q49AM1 385 aa23.57■■□□□ 1.36
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