RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613795.4

CLCN3-211, Transcript of chloride voltage-gated channel 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLCN3, Length 5,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3-211ENST00000613795 PPP2R5DQ14738 602 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 TRAF7Q6Q0C0 670 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 SLC7A3Q8WY07 619 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 MTBPQ96DY7 904 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 COQ7Q99807 217 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 GREM2Q9H772 168 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 FBXO40Q9UH90 709 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 TULP4Q9NRJ4 1543 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 ESYT2A0FGR8 921 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 ZNF839A8K0R7 811 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 H7C0C1 242 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 ABLIM1O14639 778 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 ORC4O43929 436 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 NR2F2P24468 414 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 ATP5OP48047 213 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 CACNA2D1P54289 1103 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 TNFAIP2Q03169 654 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 STX3Q13277 289 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 UNC5CLQ8IV45 518 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 TTC16Q8NEE8 873 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 CFAP36Q96G28 342 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 NSL1Q96IY1 281 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 MRGBPQ9NV56 204 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 TLK1Q9UKI8 766 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 S100A5P33763 92 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 KYNUQ16719 465 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 METTL13Q8N6R0 699 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 SNX25Q9H3E2 840 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 DKK3Q9UBP4 350 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 MCM8Q9UJA3 840 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 RAB21Q9UL25 225 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 E2F6O75461 281 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 IL10P22301 178 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 PPP2R5CQ13362 524 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 KCNB1Q14721 858 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 FBXL13Q8NEE6 735 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 MTRQ99707 1265 aa7.3□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 ASAP2O43150 1006 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 CDH16O75309 829 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 ATP4AP20648 1035 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 LRRC24Q50LG9 513 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 RAPH1Q70E73 1250 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 RFX6Q8HWS3 928 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 WDR60Q8WVS4 1066 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 POMGNT1Q8WZA1 660 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 PNKPQ96T60 521 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 SH3GL1Q99961 368 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 ERBB3P21860 1342 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 KLHL2O95198 593 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 KRT1P04264 644 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 TRIP10Q15642 601 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 BSPRYQ5W0U4 402 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 NLRP10Q86W26 655 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 RFWD2Q8NHY2 731 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 MASTLQ96GX5 879 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 BTBD6Q96KE9 485 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 KCND1Q9NSA2 647 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 UBAP1Q9NZ09 502 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 SEPT10Q9P0V9 454 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 TTC26A0AVF1 554 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 TCP10L2B9ZVM9 353 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 HMOX2P30519 316 aa7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 ADARP55265 1226 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CLCN3-211ENST00000613795 C16orf89Q6UX73 402 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms