RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610893.4

LTBP4-232, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene LTBP4, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-232ENST00000610893 GIT2Q14161 759 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 ANKRD54Q6NXT1 300 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 URGCPQ8TCY9 931 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 IGSF21Q96ID5 467 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 S1PR5Q9H228 398 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 UBN1Q9NPG3 1134 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 STK39Q9UEW8 545 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 IRAK3Q9Y616 596 aa22.11■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 RARRES1P49788 294 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 UBXN11Q5T124 520 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 VPS52Q8N1B4 723 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 CASP10Q92851 521 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 CCDC51Q96ER9 411 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 RSAD1Q9HA92 442 aa22.1■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 ATP2B1P20020 1258 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 MCM7P33993 719 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 ARL2P36404 184 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 GUCY1B3Q02153 619 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 NOTUMQ6P988 496 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 NFKBIZQ9BYH8 718 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 TMEM60Q9H2L4 133 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 ALDH2P05091 517 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 CTSAP10619 480 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 RBM25P49756 843 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 LLGL2Q6P1M3 1020 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 ZNF280BQ86YH2 543 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 FAM122AQ96E09 287 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 ZBP1Q9H171 429 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa22.08■■□□□ 1.13
LTBP4-232ENST00000610893 POTEMA6NI47 508 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 TSPAN1O60635 241 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 ITGA4P13612 1032 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 PLA2G5P39877 138 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 SLC11A1P49279 550 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 CATSPER3Q86XQ3 398 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 ASAP3Q8TDY4 903 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 NACC1Q96RE7 527 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 TMEM175Q9BSA9 504 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 GBP3Q9H0R5 595 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 DNAJB4Q9UDY4 337 aa22.07■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 DDHD2O94830 711 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 GLRA2P23416 452 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 CA8P35219 290 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 TRAPPC10P48553 1259 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 ITIH3Q06033 890 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 CAPSQ13938 189 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 FAM184AQ8NB25 1140 aa22.06■■□□□ 1.12
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LTBP4-232ENST00000610893 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 ERMNQ8TAM6 284 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 EDAQ92838 391 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 CSRNP2Q9H175 543 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 FAN1Q9Y2M0 1017 aa22.06■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 INPPL1O15357 1258 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 OR52Z1P0C646 297 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 MBTD1Q05BQ5 628 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 ZNF174Q15697 407 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 AMHR2Q16671 573 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 CES5AQ6NT32 575 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 HACE1Q8IYU2 909 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 KIF2CQ99661 725 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 IPPQ9Y573 584 aa22.05■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 TRIOO75962 3097 aa22.04■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 MUTP22033 750 aa22.04■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 RPA1P27694 616 aa22.04■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.04■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
LTBP4-232ENST00000610893 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.04■■□□□ 1.12
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