RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 PRKCEQ02156 737 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.5■■□□□ 1.03
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SGMS1-208ENST00000608287 TMX3Q96JJ7 454 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 OSMRQ99650 979 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 NRBP2Q9NSY0 501 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 DLL3Q9NYJ7 618 aa21.5■■□□□ 1.03
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SGMS1-208ENST00000608287 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
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SGMS1-208ENST00000608287 DPP7Q9UHL4 492 aa21.47■■□□□ 1.03
SGMS1-208ENST00000608287 WNT7AO00755 349 aa21.46■■□□□ 1.03
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SGMS1-208ENST00000608287 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.44■■□□□ 1.02
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SGMS1-208ENST00000608287 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa21.44■■□□□ 1.02
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SGMS1-208ENST00000608287 MTERF2Q49AM1 385 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.43■■□□□ 1.02
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SGMS1-208ENST00000608287 PPP1R16BQ96T49 567 aa21.43■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 TMEM150BA6NC51 233 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 KINO60870 393 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 STBD1O95210 358 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 VTNP04004 478 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 P4HBP07237 508 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 SKIP12755 728 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-208ENST00000608287 GJB2P29033 226 aa21.42■■□□□ 1.02
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