RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590096.1

ATG4D-212, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 1,282 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-212ENST00000590096 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 K7ERI5 159 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 SLC16A4O15374 487 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 PFKFB1P16118 471 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 AMPD3Q01432 767 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 FAM187BQ17R55 369 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 CCDC51Q96ER9 411 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 CPB2Q96IY4 423 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.48■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 A0A1W2PQ27 194 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 A0A1W2PQ64 194 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 A0A1W2PQD8 194 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 MYMKA6NI61 221 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 H0YCG3 227 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 ACKR2O00590 384 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 B4GALT5O43286 388 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 ZNF131P52739 623 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 CRIPAKQ8N1N5 446 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 RNF169Q8NCN4 708 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.47■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 HOXA2O43364 376 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 DGKIO75912 1065 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 EOMESO95936 686 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 FSIP1Q8NA03 581 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 ZNF576Q9H609 170 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 CUL9Q8IWT3 2517 aa23.46■■□□□ 1.35
ATG4D-212ENST00000590096 LCHNA4D1U4 455 aa23.45■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 STRN3Q13033 797 aa23.45■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 STAMQ92783 540 aa23.45■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.45■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 A0A1B0GUA9 196 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 K7ENM7 598 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 N4BP3O15049 544 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 TRAK2O60296 914 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 IDEP14735 1019 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 GAP43P17677 238 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 SCP2P22307 547 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 SYKP43405 635 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 NCKAP1LP55160 1127 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 SLC27A1Q6PCB7 646 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 ABI1Q8IZP0 508 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 FIBCD1Q8N539 461 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 DEFB123Q8N688 67 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 PGBD4Q96DM1 585 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 USP25Q9UHP3 1055 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 HPSEQ9Y251 543 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 COL4A6Q14031 1691 aa23.44■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 ZNF623O75123 536 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 TAP1Q03518 808 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 UBXN11Q5T124 520 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 HAUS6Q7Z4H7 955 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 CNNM3Q8NE01 707 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 ADPGKQ9BRR6 497 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 SEL1LQ9UBV2 794 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.43■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 LINC01553A4QN01 128 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 NPTXRO95502 500 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 SLFN14P0C7P3 912 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 MAPTP10636 758 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 FGFR1P11362 822 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 ABCD1P33897 745 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 GATMP50440 423 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 NDUFA8P51970 172 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 ATF7IP2Q5U623 682 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 Q7L0L9 218 aa23.42■■□□□ 1.34
ATG4D-212ENST00000590096 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms