RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 NLRP4Q96MN2 994 aa28.46■■■□□ 2.15
SCAMP4-210ENST00000588555 NFKBIZQ9BYH8 718 aa28.46■■■□□ 2.15
SCAMP4-210ENST00000588555 C2orf40Q9H1Z8 148 aa28.46■■■□□ 2.15
SCAMP4-210ENST00000588555 STYXL1Q9Y6J8 313 aa28.46■■■□□ 2.15
SCAMP4-210ENST00000588555 HOXC8P31273 242 aa28.45■■■□□ 2.15
SCAMP4-210ENST00000588555 PTENP60484 403 aa28.45■■■□□ 2.15
SCAMP4-210ENST00000588555 PPP2R3AQ06190 1150 aa28.45■■■□□ 2.15
SCAMP4-210ENST00000588555 FKBP15Q5T1M5 1219 aa28.45■■■□□ 2.15
SCAMP4-210ENST00000588555 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa28.45■■■□□ 2.15
SCAMP4-210ENST00000588555 LRRC8AQ8IWT6 810 aa28.45■■■□□ 2.15
SCAMP4-210ENST00000588555 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa28.45■■■□□ 2.15
SCAMP4-210ENST00000588555 SLAIN1Q8ND83 568 aa28.45■■■□□ 2.15
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC35C1Q96A29 364 aa28.45■■■□□ 2.15
SCAMP4-210ENST00000588555 BICD1Q96G01 975 aa28.45■■■□□ 2.15
SCAMP4-210ENST00000588555 USP20Q9Y2K6 914 aa28.45■■■□□ 2.15
SCAMP4-210ENST00000588555 GARTP22102 1010 aa28.45■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 SYCP1Q15431 976 aa28.45■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 KLHDC9Q8NEP7 349 aa28.45■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 IFT122Q9HBG6 1241 aa28.45■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 AKT3Q9Y243 479 aa28.45■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 MAPK13O15264 365 aa28.44■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 GYPCP04921 128 aa28.44■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 LIG4P49917 911 aa28.44■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNH2Q12809 1159 aa28.44■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC150Q8NCX0 1101 aa28.44■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 FBXL18Q96ME1 805 aa28.44■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 SIK3Q9Y2K2 1263 aa28.44■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 VTNP04004 478 aa28.43■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 INHAP05111 366 aa28.43■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 CST5P28325 142 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 LRMPQ12912 555 aa28.43■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC155Q8N6L0 562 aa28.43■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP28.43■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 TTLL13PA6NNM8 815 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 CXCL17Q6UXB2 119 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 POMGNT1Q8WZA1 660 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 MAP7D2Q96T17 732 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 BEGAINQ9BUH8 593 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 FZD8Q9H461 694 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 MINDY3Q9H8M7 445 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 BRCA2P51587 3418 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 DNAH12Q6ZR08 3092 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 PRKCBP05771 671 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 KLK7P49862 253 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 MBTD1Q05BQ5 628 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 RBL2Q08999 1139 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 MAPK6Q16659 721 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 ZPBP2Q6X784 338 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 TC2NQ8N9U0 490 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 RDH13Q8NBN7 331 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 HAPLN2Q9GZV7 340 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 HDAC6Q9UBN7 1215 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM17Q9Y577 477 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa28.42■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa28.41■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 ZEB2O60315 1214 aa28.41■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 AFPP02771 609 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 GRK4P32298 578 aa28.41■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 PHKA2P46019 1235 aa28.41■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 GOLGA8FQ08AF8 430 aa28.41■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa28.41■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 BFSP1Q12934 665 aa28.41■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 SAAL1Q96ER3 474 aa28.41■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 WBP1LQ9NX94 342 aa28.41■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A087WZ62 844 aa28.4■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 GOLGA8IPA6NC78 632 aa28.4■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 GOLGA8JA6NMD2 632 aa28.4■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 ADRB2P07550 413 aa28.4■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 GPC3P51654 580 aa28.4■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM14Q14142 442 aa28.4■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 RUFY4Q6ZNE9 571 aa28.4■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 CBWD2Q8IUF1 395 aa28.4■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 TTYH3Q9C0H2 523 aa28.4■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP28.39■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNMA1Q12791 1236 aa28.39■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 TCERG1LQ5VWI1 586 aa28.39■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 PPFIBP1Q86W92 1011 aa28.39■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 C7orf31Q8N865 590 aa28.39■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
SCAMP4-210ENST00000588555 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.39■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 ACKR2O00590 384 aa28.39■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 TREHO43280 583 aa28.39■■■□□ 2.13
SCAMP4-210ENST00000588555 IQCF3P0C7M6 154 aa28.39■■■□□ 2.13
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