RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGEF19Q8IW93 802 aa17.87■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM117Q9H0C3 514 aa17.87■□□□□ 0.45
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RAD51CO43502 376 aa17.86■□□□□ 0.45
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CEP170P1Q96L14 293 aa17.84■□□□□ 0.45
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TEX13BQ9BXU2 312 aa17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 THAP2Q9H0W7 228 aa17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACAD9Q9H845 621 aa17.84■□□□□ 0.45
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COQ4Q9Y3A0 265 aa17.84■□□□□ 0.45
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DGAT1O75907 488 aa17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ENPEPQ07075 957 aa17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TAF3Q5VWG9 929 aa17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRT39Q6A163 491 aa17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KLHL7Q8IXQ5 586 aa17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PARD3BQ8TEW8 1205 aa17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WHAMMQ8TF30 809 aa17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BSNDQ8WZ55 320 aa17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KLRG1Q96E93 195 aa17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
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