RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580814.1

TSG101-211, Transcript of tumor susceptibility 101, humanhuman

TSL 2

Gene TSG101, Length 441 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TSG101-211ENST00000580814 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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TSG101-211ENST00000580814 UBE3CQ15386 1083 aa7.27□□□□□ -1.25
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TSG101-211ENST00000580814 NT5DC1Q5TFE4 455 aa7.26□□□□□ -1.25
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TSG101-211ENST00000580814 LGI4Q8N135 537 aa7.26□□□□□ -1.25
TSG101-211ENST00000580814 MYO1HQ8N1T3 1032 aa7.26□□□□□ -1.25
TSG101-211ENST00000580814 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TSG101-211ENST00000580814 AIFM3Q96NN9 605 aa7.26□□□□□ -1.25
TSG101-211ENST00000580814 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.26□□□□□ -1.25
TSG101-211ENST00000580814 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TSG101-211ENST00000580814 TRIM13O60858 407 aa7.25□□□□□ -1.25
TSG101-211ENST00000580814 ALDH1A2O94788 518 aa7.25□□□□□ -1.25
TSG101-211ENST00000580814 POU2F2P09086 479 aa7.25□□□□□ -1.25
TSG101-211ENST00000580814 TCIRG1Q13488 830 aa7.25□□□□□ -1.25
TSG101-211ENST00000580814 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.25□□□□□ -1.25
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