RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	EYA4	O95677	639 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	CXCL14	O95715	111 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	ALDH2	P05091	517 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	ITGA4	P13612	1032 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	MUT	P22033	750 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	MCM2	P49736	904 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	COASY	Q13057	564 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	PTGDR	Q13258	359 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	CAPS	Q13938	189 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	NBR1	Q14596	966 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	UBXN11	Q5T124	520 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	MCTP1	Q6DN14	999 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	NOTUM	Q6P988	496 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	PADI6	Q6TGC4	694 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC51	Q96ER9	411 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	CPB2	Q96IY4	423 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	TMX3	Q96JJ7	454 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB34	Q9BZG1	259 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	GBP3	Q9H0R5	595 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	CSRNP2	Q9H175	543 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	RSAD1	Q9HA92	442 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	BARX2	Q9UMQ3	279 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	STK24	Q9Y6E0	443 aa		10.43	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	HIDE1	A8MVS5	230 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479		H3BQV1	296 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	POMC	P01189	267 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	GALT	P07902	379 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	CYP11B2	P19099	503 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	CA8	P35219	290 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	POTEG	Q6S5H5	508 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	HACE1	Q8IYU2	909 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	VPS52	Q8N1B4	723 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	10.42	□□□□□ -0.74	5e-6	■■■■□ 20.3
KIFC3-231	ENST00000567479	IGSF21	Q96ID5	467 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	IPP	Q9Y573	584 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		10.42	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR81	Q562E7	1941 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479		A0A1B0GUA9	196 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	LAD1	O00515	517 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	DDHD2	O94830	711 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	GLP2R	O95838	553 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	ALAD	P13716	330 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	COL9A1	P20849	921 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	GJB2	P29033	226 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC11A1	P49279	550 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	ZP2	Q05996	745 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	GIT2	Q14161	759 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	AMHR2	Q16671	573 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM175	Q9BSA9	504 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	RNF39	Q9H2S5	420 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	STK39	Q9UEW8	545 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
KIFC3-231	ENST00000567479	MYO7A	Q13402	2215 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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