RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 LCHNA4D1U4 455 aa23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMTNP53814 917 aa23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM187BQ17R55 369 aa23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.09■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 YME1L1Q96TA2 773 aa23.09■■□□□ 1.29
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CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A0U1RQF3 1178 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 CA3P07451 260 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 STAG3L1P0CL83 205 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 AXLP30530 894 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYKP43405 635 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 LONRF3Q496Y0 759 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF169Q8NCN4 708 aa23.08■■□□□ 1.29
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CCNDBP1-208ENST00000566515 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 INSL6Q9Y581 213 aa23.08■■□□□ 1.29
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACKR2O00590 384 aa23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLFN14P0C7P3 912 aa23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 IDEP14735 1019 aa23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 AFMP43652 599 aa23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 GATMP50440 423 aa23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBXN11Q5T124 520 aa23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOTUMQ6P988 496 aa23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAS1R3Q7RTX0 852 aa23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP57L1Q8IYX8 460 aa23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM134Q9H6X4 195 aa23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM105AQ9NUU6 356 aa23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCNG1Q9UIX4 513 aa23.08■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRAK2O60296 914 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 DGKIO75912 1065 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGEF15O94989 841 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 CASP1P29466 404 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 NCKAP1LP55160 1127 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 AMPD3Q01432 767 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM132AQ24JP5 1023 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 SFR1Q86XK3 245 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRIM9Q9C026 710 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.07■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 A0A1B0GUA9 196 aa23.06■■□□□ 1.28
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CCNDBP1-208ENST00000566515 FGFR1P11362 822 aa23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 NT5DC1Q5TFE4 455 aa23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 HAUS6Q7Z4H7 955 aa23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 PANK4Q9NVE7 773 aa23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 COL4A6Q14031 1691 aa23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 NMT1P30419 496 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 LPPQ93052 612 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC51Q96ER9 411 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 FIZ1Q96SL8 496 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 BLZF1Q9H2G9 400 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBC1D7Q9P0N9 293 aa23.05■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 K7ENM7 598 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 EOMESO95936 686 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAB27AP51159 221 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ASIC1P78348 528 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAGE5Q96GU1 130 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDZD7Q9H5P4 517 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP25Q9UHP3 1055 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 FRMD3A2A2Y4 597 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF623O75123 536 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF202O95125 648 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPTXRO95502 500 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 SKIP12755 728 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 GAP43P17677 238 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 STRN3Q13033 797 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 CUL4BQ13620 913 aa23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC27A1Q6PCB7 646 aa23.04■■□□□ 1.28
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