RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	CALML4	Q96GE6	196 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	YME1L1	Q96TA2	773 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	RBSN	Q9H1K0	784 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM51	Q9NW97	253 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	KLK14	Q9P0G3	267 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		11.18	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	NT5C1B-RDH14	C9J2C7	533 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573		F8W810	466 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	NPTX2	P47972	431 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM192	Q8IY95	271 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	CEP120	Q8N960	986 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM84A	Q96KN4	292 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ARID3A	Q99856	593 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF576	Q9H609	170 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	PCDHGC5	Q9Y5F6	944 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TRIP11	Q15643	1979 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	B4GALT3	O60512	393 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TSPAN1	O60635	241 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	RFC2	P35250	354 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	STAT6	P42226	847 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	CASP5	P51878	434 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	NDUFA8	P51970	172 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	PTEN	P60484	403 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	AMHR2	Q16671	573 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ZBTB33	Q86T24	672 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ZFP42	Q96MM3	310 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	GUCD1	Q96NT3	240 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	GBP3	Q9H0R5	595 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		11.17	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	GPR182	O15218	404 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	IDE	P14735	1019 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TAP1	Q03518	808 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	GIT2	Q14161	759 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	HYI	Q5T013	277 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	DDX12P	Q92771	950 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	COL4A6	Q14031	1691 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	LINC01553	A4QN01	128 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573		C9IYK1	514 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	YEATS4	O95619	227 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	AMH	P03971	560 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	PFKM	P08237	780 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	PRR29	P0C7W0	189 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	PFKFB1	P16118	471 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	IGFBP4	P22692	258 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	CDR1	P51861	262 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	KRT85	P78386	507 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ADGRE1	Q14246	886 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	MYCT1	Q8N699	235 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	AK8	Q96MA6	479 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		11.16	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	CAND2	O75155	1236 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	PPP6R2	O75170	966 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ERLIN2	O94905	339 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	NPTXR	O95502	500 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	POMC	P01189	267 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	SPAG1	Q07617	926 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	DSC3	Q14574	896 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	E2F4	Q16254	413 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ODR4	Q5SWX8	454 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	UBXN11	Q5T124	520 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		11.15	□□□□□ -0.62
FAM227B-208	ENST00000559573	CBX1	P83916	185 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	CUL4B	Q13620	913 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	SFR1	Q86XK3	245 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		11.15	□□□□□ -0.63
FAM227B-208	ENST00000559573	TCP11	Q8WWU5	503 aa		11.15	□□□□□ -0.63

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