RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558714.5

TMOD3-205, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-205ENST00000558714 PGS1Q32NB8 556 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 WDR72Q3MJ13 1102 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 MUM1L1Q5H9M0 696 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 CNKSR3Q6P9H4 555 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 KLHDC10Q6PID8 442 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 FAM129CQ86XR2 697 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 DENND1CQ8IV53 801 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 LINC00482Q8N8I6 264 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 PJA1Q8NG27 643 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 OR2I1PQ8NGU4 316 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 SVIPQ8NHG7 77 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 PPP1R35Q8TAP8 253 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 FBXO41Q8TF61 875 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 FATE1Q969F0 183 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 RPS6KC1Q96S38 1066 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 PSMD1Q99460 953 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 POLR3GLQ9BT43 218 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 GREM2Q9H772 168 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 PCDH18Q9HCL0 1135 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 PLEKHD1A6NEE1 506 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 H3BML4 177 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 APAF1O14727 1248 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 KNG1P01042 644 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 INHBBP09529 407 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 RHCEP18577 417 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 XPAP23025 273 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 RHDQ02161 417 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 MGAT2Q10469 447 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 BIRC2Q13490 618 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 BRD3Q15059 726 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 LCE4AQ5TA78 99 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 LMBR1LQ6UX01 489 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 MIGA2Q7L4E1 593 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 OTOP2Q7RTS6 562 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 CAMKK1Q8N5S9 505 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 SAMD3Q8N6K7 520 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 KYQ8NBH2 561 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 KAT5Q92993 513 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 TTC17Q96AE7 1141 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 ADI1Q9BV57 179 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 FAM204AQ9H8W3 233 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 PARD6AQ9NPB6 346 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 MAN1C1Q9NR34 630 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 DNAI1Q9UI46 699 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 FBXO10Q9UK96 956 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 CROTQ9UKG9 612 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 INTUQ9ULD6 942 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 FAM50BQ9Y247 325 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 A0A0G2JNJ9 132 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 A0A1W2PR48 441 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 FAM171A2A8MVW0 826 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 H0Y858 1186 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 B3GALT2O43825 422 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 TUSC2O75896 110 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 UBXN7O94888 489 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 LY86O95711 162 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 ZBED1O96006 694 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 CHGBP05060 677 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 ALDH2P05091 517 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 PHKG2P15735 406 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 BMP7P18075 431 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 STAT5BP51692 787 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 NEK3P51956 506 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 FOXO4P98177 505 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 CD69Q07108 199 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 IL10RAQ13651 578 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 SEPT2Q15019 361 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 COBLL1Q53SF7 1204 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 PRR31Q5SQ13 230 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 IL31Q6EBC2 164 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 UNC5BQ8IZJ1 945 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 FAM43AQ8N2R8 423 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 TTLL6Q8N841 843 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 PIK3C3Q8NEB9 887 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 MORC4Q8TE76 937 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 DPF2Q92785 391 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 HDAC10Q969S8 669 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-205ENST00000558714 ZBTB8AQ96BR9 441 aa3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms