RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	PRAMEF1	O95521	474 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	FGA	P02671	866 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ATP2B1	P20020	1258 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	BACE1	P56817	501 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	EGR3	Q06889	387 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	PLS1	Q14651	629 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	TCEAL1	Q15170	157 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SBK1	Q52WX2	424 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	VHLL	Q6RSH7	139 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	CASC1	Q6TDU7	716 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	TCTN2	Q96GX1	697 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ERO1A	Q96HE7	468 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC17	Q96LX7	622 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAJC18	Q9H819	358 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM17	Q9Y577	477 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		5.47	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.53
ATXN3-238	ENST00000556288	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	TLR2	O60603	784 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	PEX10	O60683	326 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CD247	P20963	164 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CHML	P26374	656 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	PSMC4	P43686	418 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	USP14	P54578	494 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ICA1	Q05084	483 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	HDAC8	Q9BY41	377 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	SH2D4A	Q9H788	454 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	STX8	Q9UNK0	236 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		5.46	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	RLF	Q13129	1914 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A1W2PRG0	241 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	SHOX	O15266	292 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	NMT2	O60551	498 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	FLOT1	O75955	427 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	HOXD10	P28358	340 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	GUCY1A2	P33402	732 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	PTH1R	Q03431	593 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	GABPA	Q06546	454 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	TRDN	Q13061	729 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ALX1	Q15699	326 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	FXN	Q16595	210 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	RAET1E	Q8TD07	263 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	BRF1	Q92994	677 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	COA7	Q96BR5	231 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	GP6	Q9HCN6	339 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	PRR13	Q9NZ81	148 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	PCNT	O95613	3336 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	KAT6A	Q92794	2004 aa		5.45	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288		B4E1Z4	1266 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288		F5H6K3	240 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	PPM1B	O75688	479 aa		5.44	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	DDAH1	O94760	285 aa		5.44	□□□□□ -1.54

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