RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PPME1	Q9Y570	386 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CACNA1H	O95180	2353 aa		7.68	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688		A0A087WZ62	844 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	STK25	O00506	426 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CHMP2A	O43633	222 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	JAK2	O60674	1132 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	NR1I2	O75469	434 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PSMD10	O75832	226 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SOD2	P04179	222 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	UROD	P06132	367 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ADH1A	P07327	375 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SRF	P11831	508 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	RFX1	P22670	979 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SLC11A1	P49279	550 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ST3GAL1	Q11201	340 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	MTERF2	Q49AM1	385 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688		Q4G0T1	1027 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	KANK3	Q6NY19	840 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	RHPN2	Q8IUC4	686 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	FBXL16	Q8N461	479 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	LPP	Q93052	612 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	AIFM3	Q96NN9	605 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CEP89	Q96ST8	783 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	RSAD1	Q9HA92	442 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	AGPAT5	Q9NUQ2	364 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	FAM120A	Q9NZB2	1118 aa	Known RBP eCLIP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CPLX1	O14810	134 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ADAMTS3	O15072	1205 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ASAP2	O43150	1006 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	DDHD2	O94830	711 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PAPLN	O95428	1278 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	GLUD1	P00367	558 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CYP3A7	P24462	503 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PSMC5	P62195	406 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	DRP2	Q13474	957 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	RABEP1	Q15276	862 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	UGCG	Q16739	394 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SHD	Q96IW2	340 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	NLRP4	Q96MN2	994 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	GBP3	Q9H0R5	595 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	NRP1	O14786	923 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	INPPL1	O15357	1258 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	TEX28	O15482	410 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	PFKFB2	O60825	505 aa		7.65	□□□□□ -1.18
CS-233	ENST00000552688	CLUH	O75153	1309 aa		7.65	□□□□□ -1.18

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