RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		15.53	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	AGO4	Q9HCK5	861 aa	Known RBP	15.53	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		15.53	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		15.53	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		15.53	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	C2CD2L	O14523	706 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	ATG7	O95352	703 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	CD72	P21854	359 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	KLRC2	P26717	231 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	SLC11A1	P49279	550 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	AP3B2	Q13367	1082 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	LPAL2	Q16609	132 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	BLID	Q8IZY5	108 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	IGSF21	Q96ID5	467 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		15.52	■□□□□ 0.08
CS-231	ENST00000552222	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	USP24	Q9UPU5	2620 aa		15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222		M0R2N6	131 aa		15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	HBP1	O60381	514 aa		15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	GALT	P07902	379 aa		15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	GJB2	P29033	226 aa		15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	TRIM29	Q14134	588 aa		15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	SDF4	Q9BRK5	362 aa		15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	KIF3A	Q9Y496	699 aa		15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		15.51	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	CHD6	Q8TD26	2715 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	HOXA2	O43364	376 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	ADRB1	P08588	477 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	SRF	P11831	508 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	PJA1	Q8NG27	643 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	C8orf76	Q96K31	380 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	ANO3	Q9BYT9	981 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	ZNF302	Q9NR11	478 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	USP18	Q9UMW8	372 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	AKT3	Q9Y243	479 aa		15.5	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		15.49	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	KCNA4	P22459	653 aa		15.49	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	SREBF1	P36956	1147 aa		15.49	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	FOSB	P53539	338 aa		15.49	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	GPC5	P78333	572 aa		15.49	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	DRP2	Q13474	957 aa		15.49	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		15.49	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	OXER1	Q8TDS5	423 aa		15.49	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	IRAK3	Q9Y616	596 aa		15.49	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	15.49	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		15.49	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	NFASC	O94856	1347 aa		15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222		A0A0U1RQF3	1178 aa		15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222		F8W810	466 aa		15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	INPPL1	O15357	1258 aa		15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	LILRB3	O75022	631 aa		15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	DDHD2	O94830	711 aa		15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	GUCY1B3	Q02153	619 aa		15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	ZNF707	Q96C28	371 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	B3GALT6	Q96L58	329 aa		15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	CLUH	O75153	1309 aa		15.47	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	KRT2	P35908	639 aa		15.47	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	NR5A1	Q13285	461 aa		15.47	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	PPM1J	Q5JR12	505 aa		15.47	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	ODR4	Q5SWX8	454 aa		15.47	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		15.47	■□□□□ 0.07
CS-231	ENST00000552222	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		15.47	■□□□□ 0.07

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